RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 GOLGA2Q08379 1002 aa36.32■■■■□ 3.41
TRAPPC10-202ENST00000380221 PDE3BQ13370 1112 aa36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 UNC5CLQ8IV45 518 aa36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCL9LQ86UU0 1499 aa36.32■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMOD3Q0VAK6 560 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCTN1Q14203 1278 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 WDR63Q8IWG1 891 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL2RBP14784 551 aa36.27■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36.26■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.26■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 USP21Q9UK80 565 aa36.26■■■■□ 3.4
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNAT3A8MTJ3 354 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 MAP3K5Q99683 1374 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 MCM10Q7L590 875 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLFN5Q08AF3 891 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.23■■■■□ 3.392e-8■□□□□ 9.3
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPG7Q9UQ90 795 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 AFF2P51816 1311 aa36.22■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 AKAP4Q5JQC9 854 aa36.21■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 VPS72Q15906 364 aa36.2■■■■□ 3.39
TRAPPC10-202ENST00000380221 E9PSI1 815 aa36.2■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.2■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 DISP2A7MBM2 1401 aa36.19■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.18■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 DUSP27Q5VZP5 1158 aa36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL17REQ8NFR9 667 aa36.16■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 IL16Q14005 1332 aa36.16■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CYP27B1O15528 508 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 PHKG2P15735 406 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 LGR6Q9HBX8 967 aa36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.11■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.11■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 BARGINQ6ZT62 677 aa36.1■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYH16Q9H6N6 1097 aa36.1■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 LRRC37A3O60309 1634 aa36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFT57Q9NWB7 429 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNMTO43148 476 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF853P0CG23 659 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GNAI1P63096 354 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP44Q96MT7 982 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ATRNO75882 1429 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXOC5O00471 708 aa36.04■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa36.04■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEFLP07196 543 aa36.02■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 GLI3P10071 1580 aa36.02■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 MBIPQ9NS73 344 aa36.02■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 SCN11AQ9UI33 1791 aa36.01■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNS2Q63HR2 1409 aa36.01■■■■□ 3.36
TRAPPC10-202ENST00000380221 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 DDB1Q16531 1140 aa36■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCAF5Q96JK2 942 aa36■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 MIS18AQ9NYP9 233 aa36■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHL1O00533 1208 aa35.99■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 TEFQ10587 303 aa35.98■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 FKBP8Q14318 412 aa35.96■■■■□ 3.35
TRAPPC10-202ENST00000380221 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 TSPYL4Q9UJ04 414 aa35.94■■■■□ 3.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 A0A0G2JS52 829 aa35.93■■■■□ 3.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYT1Q01538 1121 aa35.93■■■■□ 3.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa35.91■■■■□ 3.34
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC52A2Q9HAB3 445 aa35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms