RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376582.7

TIMM17B-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM17B, Length 950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-201ENST00000376582 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.46■■□□□ 1.67
TIMM17B-201ENST00000376582 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TIMM17B-201ENST00000376582 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 NUDCQ9Y266 331 aa25.45■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 SPG7Q9UQ90 795 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 HMOX1P09601 288 aa25.42■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 KDRP35968 1356 aa25.42■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 BCL9O00512 1426 aa25.41■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 TRIM37O94972 964 aa25.41■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.39■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.39■■□□□ 1.66
TIMM17B-201ENST00000376582 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.39■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.39■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 CYP27B1O15528 508 aa25.38■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.38■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 ANP32CO43423 234 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.35■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 APBA3O96018 575 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 PHKG2P15735 406 aa25.33■■□□□ 1.65
TIMM17B-201ENST00000376582 KCNQ2O43526 872 aa25.32■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.32■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 FCHSD2O94868 740 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 BAG6P46379 1132 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 EP400Q96L91 3159 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.29■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 PRKAR2BP31323 418 aa25.28■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.27■■□□□ 1.64
TIMM17B-201ENST00000376582 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 PLSCR1O15162 318 aa25.24■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.24■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 DCAF5Q96JK2 942 aa25.24■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.24■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 SBF2Q86WG5 1849 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.23■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TIMM17B-201ENST00000376582 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.2■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 NEFMP07197 916 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 CCDC184Q52MB2 194 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 NHSQ6T4R5 1651 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 PIGBQ92521 554 aa25.17■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.16■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.16■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.16■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 LGR6Q9HBX8 967 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 CABP4P57796 275 aa25.14■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 PROM2Q8N271 834 aa25.14■■□□□ 1.62
TIMM17B-201ENST00000376582 MRS2Q9HD23 443 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 TXNRD1Q16881 649 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 MAP3K5Q99683 1374 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.11■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.1■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 IL17REQ8NFR9 667 aa25.1■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 BTAF1O14981 1849 aa25.09■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 NFE2L2Q16236 605 aa25.09■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 RUNDC1Q96C34 613 aa25.09■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.08■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.08■■□□□ 1.61
TIMM17B-201ENST00000376582 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 ATG3Q9NT62 314 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 ITGB4P16144 1822 aa25.05■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 PALLDQ8WX93 1383 aa25.05■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 TEFQ10587 303 aa25.04■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 NBPF14Q5TI25 921 aa25.04■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.04■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TIMM17B-201ENST00000376582 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms