RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 ERVK-9P63128 1117 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 NR1H3Q13133 447 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 RNF20Q5VTR2 975 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRK-202ENST00000368205 GPR37L1O60883 481 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 SVOPQ8N4V2 548 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 GMCL1Q96IK5 515 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1W2PRU2 124 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGEF15O94989 841 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 WHAMMQ8TF30 809 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 APBB1O00213 710 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 MEN1O00255 615 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 TRAK2O60296 914 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTS2O95450 1211 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 RHOQP17081 205 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 CLN3Q13286 438 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 GAS6Q14393 721 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRK-202ENST00000368205 RASSF7Q02833 373 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 SCTRP47872 440 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 WDR44Q5JSH3 913 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 NLRP3Q96P20 1036 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 GDF11O95390 407 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 SNRKQ9NRH2 765 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 POU4F2Q12837 409 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 DBN1Q16643 649 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 MBIPQ9NS73 344 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 H7C1W4 665 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 FOXR1Q6PIV2 292 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 NBPF15Q8N660 670 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRK-202ENST00000368205 GNRH1P01148 92 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 MAP3K10Q02779 954 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 KANK3Q6NY19 840 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 IGF1RP08069 1367 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 GPR25O00155 361 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 MYCP01106 439 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 IL2RAP01589 272 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 IRS1P35568 1242 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 CNKSR1Q969H4 720 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 ENAMQ9NRM1 1142 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 F11P03951 625 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 CENPCQ03188 943 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 XAGE2Q96GT9 111 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRK-202ENST00000368205 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 BCRP11274 1271 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 MX2P20592 715 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 ACDQ96AP0 544 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRK-202ENST00000368205 A0A1B0GTH6 734 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms