RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-201ENST00000366391 MORC1Q86VD1 984 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-201ENST00000366391 NCAPD2Q15021 1401 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP5-201ENST00000366391 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SH3BP5-201ENST00000366391 ITGB4P16144 1822 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 PLSCR1O15162 318 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNQ2O43526 872 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 EYA1Q99502 592 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP5-201ENST00000366391 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 LY75O60449 1722 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 LRP5O75197 1615 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 PROM2Q8N271 834 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP5-201ENST00000366391 NBPF14Q5TI25 921 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 TXNRD1Q16881 649 aa25.12■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP27B1O15528 508 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 MTHFSP49914 203 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PAPPAQ13219 1627 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 SPG7Q9UQ90 795 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 CASZ1Q86V15 1759 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5-201ENST00000366391 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 IL13P35225 146 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 KDRP35968 1356 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 C5P01031 1676 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5-201ENST00000366391 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 PHKG2P15735 406 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 STK32BQ9NY57 414 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC15A2Q16348 729 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 HMOX1P09601 288 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNQ4P56696 695 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 PIGBQ92521 554 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 PALLDQ8WX93 1383 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 PPP2R1AP30153 589 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF827Q17R98 1081 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 DCAF5Q96JK2 942 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 AKT1S1Q96B36 256 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 CFAP53Q96M91 514 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 C4BP0C0L5 1744 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 SPON1Q9HCB6 807 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-201ENST00000366391 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 ZBTB7AO95365 584 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 ATG3Q9NT62 314 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 CABP4P57796 275 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 NUDCQ9Y266 331 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-201ENST00000366391 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.8■■□□□ 1.56
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