RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 REC8O95072 547 aa22.52■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
LRRC25-201ENST00000339007 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 RAPGEF3O95398 923 aa22.51■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 CEP85Q6P2H3 762 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 GPT2Q8TD30 523 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 FAM83GA6ND36 823 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.48■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.48■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 RGS12O14924 1447 aa22.47■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 ERC2O15083 957 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 DCTN1Q14203 1278 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 RTL1A6NKG5 1358 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 NEO1Q92859 1461 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 APBB1O00213 710 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC25-201ENST00000339007 NME9Q86XW9 330 aa22.45■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 MSH6P52701 1360 aa22.45■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 DLC1Q96QB1 1528 aa22.45■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 MCM5P33992 734 aa22.43■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 MBD3O95983 291 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 PTPRCP08575 1304 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 SYCE3A1L190 88 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 COG3Q96JB2 828 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 MEIS3Q99687 375 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 HMMRO75330 724 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 KRT24Q2M2I5 525 aa22.39■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 KIAA0232Q92628 1395 aa22.39■■□□□ 1.18
LRRC25-201ENST00000339007 MCM2P49736 904 aa22.39■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 NEK4P51957 841 aa22.39■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 TMX3Q96JJ7 454 aa22.39■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 CHL1O00533 1208 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 MAP7D2Q96T17 732 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 PDE1AP54750 535 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 BRD1O95696 1058 aa22.36■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 UQCRHP07919 91 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 RICTORQ6R327 1708 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.35■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 MCCP23508 829 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 CUL4AQ13619 759 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 CPS1P31327 1500 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC25-201ENST00000339007 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 MCM10Q7L590 875 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 RNF214Q8ND24 703 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 SLC4A2P04920 1241 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 TSPY26PQ9H489 355 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 ANAPC15P60006 121 aa22.31■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 DYNC1I1O14576 645 aa22.3■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.29■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.28■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.28■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 PHF14O94880 888 aa22.28■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 C3P01024 1663 aa22.27■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 PALD1Q9ULE6 856 aa22.27■■□□□ 1.16
LRRC25-201ENST00000339007 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms