RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.52■■□□□ 1.36
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NOP56-201ENST00000329276 DIP2BQ9P265 1576 aa23.52■■□□□ 1.36
NOP56-201ENST00000329276 ERC2O15083 957 aa23.51■■□□□ 1.35
NOP56-201ENST00000329276 NFE2L2Q16236 605 aa23.51■■□□□ 1.35
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NOP56-201ENST00000329276 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.47■■□□□ 1.35
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NOP56-201ENST00000329276 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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NOP56-201ENST00000329276 CEP85Q6P2H3 762 aa23.41■■□□□ 1.34
NOP56-201ENST00000329276 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NOP56-201ENST00000329276 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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NOP56-201ENST00000329276 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
NOP56-201ENST00000329276 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.39■■□□□ 1.34
NOP56-201ENST00000329276 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
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NOP56-201ENST00000329276 USP25Q9UHP3 1055 aa23.38■■□□□ 1.33
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NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.36■■□□□ 1.33
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NOP56-201ENST00000329276 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
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NOP56-201ENST00000329276 RICTORQ6R327 1708 aa23.32■■□□□ 1.32
NOP56-201ENST00000329276 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NOP56-201ENST00000329276 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.32■■□□□ 1.32
NOP56-201ENST00000329276 KDM4AO75164 1064 aa23.32■■□□□ 1.32
NOP56-201ENST00000329276 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NOP56-201ENST00000329276 PDE1AP54750 535 aa23.32■■□□□ 1.32
NOP56-201ENST00000329276 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.32■■□□□ 1.32
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