RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 CERKQ8TCT0 537 aa30.91■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 MAP3K5Q99683 1374 aa30.91■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 GNAT3A8MTJ3 354 aa30.89■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 CFAP44Q96MT7 982 aa30.89■■■□□ 2.54
TMIE-201ENST00000326431 CRB1P82279 1406 aa30.89■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.88■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 MBIPQ9NS73 344 aa30.87■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 PLIN1O60240 522 aa30.86■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 MEGF6O75095 1541 aa30.86■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.85■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 BCAR3O75815 825 aa30.84■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa30.84■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
TMIE-201ENST00000326431 RARSP54136 660 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 PKD1L3Q7Z443 1732 aa30.82■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.82■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 IL17REQ8NFR9 667 aa30.82■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.81■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 CHL1O00533 1208 aa30.8■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 TATP17735 454 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 STRN4Q9NRL3 753 aa30.8■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 PLCH1Q4KWH8 1693 aa30.8■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 AKAP4Q5JQC9 854 aa30.8■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 BTG4Q9NY30 223 aa30.79■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 EVA1CP58658 441 aa30.78■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa30.77■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa30.77■■■□□ 2.52
TMIE-201ENST00000326431 C1orf141Q5JVX7 400 aa30.76■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.75■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa30.75■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.75■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 TSPYL6Q8N831 410 aa30.74■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 LGR6Q9HBX8 967 aa30.74■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.73■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 SCN11AQ9UI33 1791 aa30.73■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.73■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 ADAMTS2O95450 1211 aa30.73■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 C20orf194Q5TEA3 1177 aa30.73■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 NRAPQ86VF7 1730 aa30.72■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.72■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.72■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 SPG7Q9UQ90 795 aa30.72■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa30.71■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 VAMP4O75379 141 aa30.7■■■□□ 2.51
TMIE-201ENST00000326431 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.69■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.69■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 JCADQ9P266 1359 aa30.69■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 KDM3BQ7LBC6 1761 aa30.69■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 RNMTO43148 476 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.68■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.68■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 KRT24Q2M2I5 525 aa30.67■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 PHKG2P15735 406 aa30.66■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 ZNF428Q96B54 188 aa30.66■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 PPP4R2Q9NY27 417 aa30.66■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 NWD2Q9ULI1 1742 aa30.66■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.66■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 IL2RBP14784 551 aa30.65■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 CANXP27824 592 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 CRBNQ96SW2 442 aa30.65■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.65■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.65■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 USP35Q9P2H5 1018 aa30.64■■■□□ 2.5
TMIE-201ENST00000326431 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 CYP27B1O15528 508 aa30.63■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 IFNL2Q8IZJ0 200 aa30.63■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 TEFQ10587 303 aa30.62■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 SLIT2O94813 1529 aa30.59■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 PDE3AQ14432 1141 aa30.59■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 TNNQ9UQP3 1299 aa30.58■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa30.57■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa30.57■■■□□ 2.49
TMIE-201ENST00000326431 DISP2A7MBM2 1401 aa30.56■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 HSPA1LP34931 641 aa30.56■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.56■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 KIF16BQ96L93 1317 aa30.55■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 BTBD11A6QL63 1104 aa30.55■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 PANK1Q8TE04 598 aa30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms