RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTAF1O14981 1849 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNQ2O43526 872 aa26.72■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.71■■□□□ 1.87
PTPRCAP-201ENST00000326294 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 EYA1Q99502 592 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLSCR1O15162 318 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PROM2Q8N271 834 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP27B1O15528 508 aa26.59■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRP5O75197 1615 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNRD1Q16881 649 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTHFSP49914 203 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAPPAQ13219 1627 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF14Q5TI25 921 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL13P35225 146 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPG7Q9UQ90 795 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY75O60449 1722 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGB4P16144 1822 aa26.55■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDRP35968 1356 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASZ1Q86V15 1759 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHKG2P15735 406 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK32BQ9NY57 414 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC15A2Q16348 729 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PALLDQ8WX93 1383 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 C5P01031 1676 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMOX1P09601 288 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP2R1AP30153 589 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNQ4P56696 695 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF827Q17R98 1081 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIGBQ92521 554 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKT1S1Q96B36 256 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCAF5Q96JK2 942 aa26.34■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP53Q96M91 514 aa26.33■■□□□ 1.81
PTPRCAP-201ENST00000326294 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.31■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPON1Q9HCB6 807 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.29■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4BP0C0L5 1744 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.28■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZBTB7AO95365 584 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG3Q9NT62 314 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRC1P22897 1456 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 CABP4P57796 275 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIK1P57059 783 aa26.24■■□□□ 1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDCQ9Y266 331 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms