RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.55■■□□□ 1.36
MVB12A-201ENST00000317040 NCLP19338 710 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
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MVB12A-201ENST00000317040 ST18O60284 1047 aa23.53■■□□□ 1.36
MVB12A-201ENST00000317040 USP26Q9BXU7 913 aa23.53■■□□□ 1.36
MVB12A-201ENST00000317040 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.53■■□□□ 1.36
MVB12A-201ENST00000317040 STRCQ7RTU9 1775 aa23.52■■□□□ 1.36
MVB12A-201ENST00000317040 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
MVB12A-201ENST00000317040 GPT2Q8TD30 523 aa23.52■■□□□ 1.36
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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MVB12A-201ENST00000317040 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.5■■□□□ 1.35
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MVB12A-201ENST00000317040 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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MVB12A-201ENST00000317040 FCHSD2O94868 740 aa23.48■■□□□ 1.35
MVB12A-201ENST00000317040 CASC1Q6TDU7 716 aa23.48■■□□□ 1.35
MVB12A-201ENST00000317040 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.48■■□□□ 1.35
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MVB12A-201ENST00000317040 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.47■■□□□ 1.35
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MVB12A-201ENST00000317040 KLHL34Q8N239 644 aa23.46■■□□□ 1.35
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MVB12A-201ENST00000317040 DCTPP1Q9H773 170 aa23.46■■□□□ 1.35
MVB12A-201ENST00000317040 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.46■■□□□ 1.35
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MVB12A-201ENST00000317040 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
MVB12A-201ENST00000317040 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.45■■□□□ 1.35
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1W2PP64 1363 aa23.45■■□□□ 1.35
MVB12A-201ENST00000317040 VAMP4O75379 141 aa23.45■■□□□ 1.34
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MVB12A-201ENST00000317040 REC8O95072 547 aa23.44■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 MCM2P49736 904 aa23.44■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 UVSSAQ2YD98 709 aa23.44■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 FAM184AQ8NB25 1140 aa23.43■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.43■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 PHF14O94880 888 aa23.43■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 PKP1Q13835 747 aa23.43■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 SYCE3A1L190 88 aa23.42■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 TSPY26PQ9H489 355 aa23.42■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.42■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.42■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.41■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 IFT57Q9NWB7 429 aa23.41■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 TBX22Q9Y458 520 aa23.41■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 GNAI1P63096 354 aa23.4■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.4■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.4■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.39■■□□□ 1.34
MVB12A-201ENST00000317040 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.39■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 BRD1O95696 1058 aa23.37■■□□□ 1.33
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MVB12A-201ENST00000317040 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.37■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF853P0CG23 659 aa23.37■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 ALKQ9UM73 1620 aa23.37■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 NFE2L2Q16236 605 aa23.36■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 METP08581 1390 aa23.36■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 FYB1O15117 783 aa23.35■■□□□ 1.33
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MVB12A-201ENST00000317040 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.35■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.35■■□□□ 1.33
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MVB12A-201ENST00000317040 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.34■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.34■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 ERC2O15083 957 aa23.33■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 ATP10DQ9P241 1426 aa23.33■■□□□ 1.33
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MVB12A-201ENST00000317040 CABP2Q9NPB3 220 aa23.33■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.33■■□□□ 1.33
MVB12A-201ENST00000317040 KIF20AO95235 890 aa23.32■■□□□ 1.32
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MVB12A-201ENST00000317040 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 PRKAR2BP31323 418 aa23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 ANAPC15P60006 121 aa23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 TMX3Q96JJ7 454 aa23.29■■□□□ 1.32
MVB12A-201ENST00000317040 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
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