RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CABP4P57796 275 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa28.41■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC102AQ96A19 550 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCL3Q9H2J4 239 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 SOGA3Q5TF21 947 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 OSCARQ8IYS5 282 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ERICH4A6NGS2 130 aa28.4■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP2B2Q01814 1243 aa28.39■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.39■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 UBXN4Q92575 508 aa28.38■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 FCHSD2O94868 740 aa28.37■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX11Q96FC9 970 aa28.37■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP100Q494V2 611 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 TAX1BP1Q86VP1 789 aa28.36■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD62A6NC57 917 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC83Q8IWF9 413 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 WASF1Q92558 559 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNJ2O15056 1496 aa28.35■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1328Q86T90 577 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 UBAC1Q9BSL1 405 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 NFE2L2Q16236 605 aa28.34■■■□□ 2.13
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GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC183Q5T5S1 534 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.34■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 TDO2P48775 406 aa28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.33■■■□□ 2.13
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD11A6QL63 1104 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 TMCO3Q6UWJ1 677 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 SPG7Q9UQ90 795 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN14Q15678 1187 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 MX1P20591 662 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 FERMT3Q86UX7 667 aa28.32■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL34Q8N239 644 aa28.31■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.31■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 STRN4Q9NRL3 753 aa28.31■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.31■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 USP8P40818 1118 aa28.31■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.3■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP131Q9UPN4 1083 aa28.3■■■□□ 2.12
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GNPTAB-201ENST00000299314 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF4BQ92750 862 aa28.29■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.29■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.28■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 SKAP1Q86WV1 359 aa28.28■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.27■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN12O43309 604 aa28.27■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 GBP3Q9H0R5 595 aa28.27■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO10Q9NW15 660 aa28.27■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF3Q5VWG9 929 aa28.26■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.26■■■□□ 2.12
GNPTAB-201ENST00000299314 DAPK1P53355 1430 aa28.26■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB11FIP3O75154 756 aa28.26■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SSFA2P28290 1259 aa28.26■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CBX1P83916 185 aa28.26■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.25■■■□□ 2.11
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GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.25■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CASQ1P31415 396 aa28.25■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
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GNPTAB-201ENST00000299314 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF18AQ8NI77 898 aa28.24■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
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GNPTAB-201ENST00000299314 RAI14Q9P0K7 980 aa28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TIAM1Q13009 1591 aa28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.23■■■□□ 2.11
GNPTAB-201ENST00000299314 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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