RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 CRB1P82279 1406 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 MEGF6O75095 1541 aa27.01■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K5Q99683 1374 aa27.01■■□□□ 1.92
PACSIN3-201ENST00000298838 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 NRAPQ86VF7 1730 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 DCTN1Q14203 1278 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 MCM10Q7L590 875 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC37A3O60309 1634 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 IFT57Q9NWB7 429 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-201ENST00000298838 SLIT2O94813 1529 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 GNAI1P63096 354 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 SPG7Q9UQ90 795 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 LRP6O75581 1613 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP44Q96MT7 982 aa26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 IL2RBP14784 551 aa26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF853P0CG23 659 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 USP35Q9P2H5 1018 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 C8orf37Q96NL8 207 aa26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-201ENST00000298838 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 IL17REQ8NFR9 667 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 NGLY1Q96IV0 654 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 MBIPQ9NS73 344 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 CHL1O00533 1208 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 PHKG2P15735 406 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 DISP2A7MBM2 1401 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 NEFLP07196 543 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-201ENST00000298838 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.83■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 LGR6Q9HBX8 967 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP27B1O15528 508 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 TEFQ10587 303 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF5Q96JK2 942 aa26.78■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 VPS72Q15906 364 aa26.76■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.76■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 USP21Q9UK80 565 aa26.76■■□□□ 1.88
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.75■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 MRC1P22897 1456 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 BARGINQ6ZT62 677 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 TNS2Q63HR2 1409 aa26.74■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF428Q96B54 188 aa26.73■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 AFF2P51816 1311 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.72■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 EXOC5O00471 708 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 BCAR3O75815 825 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP8Q14318 412 aa26.71■■□□□ 1.87
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPYL6Q8N831 410 aa26.71■■□□□ 1.87
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