RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 MS4A1P11836 297 aa29.15■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 ALS2Q96Q42 1657 aa29.14■■■□□ 2.26
VSTM4-201ENST00000298454 IGHDP01880 384 aa29.13■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.11■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 AAMPQ13685 434 aa29.11■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 KRT24Q2M2I5 525 aa29.11■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.09■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.09■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.09■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.09■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.08■■■□□ 2.25
VSTM4-201ENST00000298454 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.07■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.06■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K5Q99683 1374 aa29.05■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 BRINP3Q76B58 766 aa29.05■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 PXDNQ92626 1479 aa29.05■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.04■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0232Q92628 1395 aa29.04■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.04■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.03■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 IL17REQ8NFR9 667 aa29.03■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.02■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.02■■■□□ 2.24
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.01■■■□□ 2.23
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC37A3O60309 1634 aa29■■■□□ 2.23
VSTM4-201ENST00000298454 SLAIN2Q9P270 581 aa28.99■■■□□ 2.23
VSTM4-201ENST00000298454 NCAPD2Q15021 1401 aa28.98■■■□□ 2.23
VSTM4-201ENST00000298454 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
VSTM4-201ENST00000298454 ERBB3P21860 1342 aa28.97■■■□□ 2.23
VSTM4-201ENST00000298454 RGPD5Q99666 1765 aa28.95■■■□□ 2.23
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.95■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC4O15439 1325 aa28.93■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 PDE4AP27815 886 aa28.93■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 RGS3P49796 1198 aa28.93■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.92■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 LGR6Q9HBX8 967 aa28.91■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.91■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 CHRNA2Q15822 529 aa28.91■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.9■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.89■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 BACH2Q9BYV9 841 aa28.89■■■□□ 2.22
VSTM4-201ENST00000298454 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.89■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 COL18A1P39060 1754 aa28.87■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.87■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A2P04920 1241 aa28.86■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.86■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.86■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.85■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 RGS12O14924 1447 aa28.84■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.84■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 CPDO75976 1380 aa28.83■■■□□ 2.21
VSTM4-201ENST00000298454 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.82■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRCP08575 1304 aa28.82■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.82■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 G2E3Q7L622 706 aa28.8■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 TEFQ10587 303 aa28.79■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.79■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.79■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 NECTIN2Q92692 538 aa28.79■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 ABCC6O95255 1503 aa28.78■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.77■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 STK31Q9BXU1 1019 aa28.77■■■□□ 2.2
VSTM4-201ENST00000298454 KCNQ3O43525 872 aa28.75■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 MEGF6O75095 1541 aa28.75■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD11A6QL63 1104 aa28.75■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 FAM161AQ3B820 660 aa28.74■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.74■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 C8orf34Q49A92 452 aa28.74■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 SMC5Q8IY18 1101 aa28.73■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.72■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.72■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 F6X3S4 739 aa28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms