RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 LRRC37A3O60309 1634 aa33.41■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.4■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.4■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa33.4■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.4■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.39■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
FOXQ1-201ENST00000296839 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.38■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 DDX19BQ9UMR2 479 aa33.38■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 KIAA0232Q92628 1395 aa33.37■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 ITPRIPQ8IWB1 547 aa33.37■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 TMEM57Q8N5G2 664 aa33.37■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 ARHGAP45Q92619 1136 aa33.37■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.36■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 MSH6P52701 1360 aa33.36■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 NBPF6Q5VWK0 638 aa33.35■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 NBPF4Q96M43 638 aa33.35■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 GNAT3A8MTJ3 354 aa33.33■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 PDE4AP27815 886 aa33.33■■■□□ 2.93
FOXQ1-201ENST00000296839 MAP3K5Q99683 1374 aa33.32■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 PLEKHG5O94827 1062 aa33.31■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 KRT24Q2M2I5 525 aa33.31■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.29■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 BACH2Q9BYV9 841 aa33.29■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.28■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 TSPYL4Q9UJ04 414 aa33.28■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.28■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 NCAPD2Q15021 1401 aa33.28■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 RGPD5Q99666 1765 aa33.27■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 MIS18AQ9NYP9 233 aa33.27■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
FOXQ1-201ENST00000296839 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa33.26■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCC4O15439 1325 aa33.26■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 PXDNQ92626 1479 aa33.25■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 RGS3P49796 1198 aa33.24■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 IL17REQ8NFR9 667 aa33.24■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.24■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.23■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 AXIN2Q9Y2T1 843 aa33.22■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.21■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.2■■■□□ 2.91
FOXQ1-201ENST00000296839 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.19■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 BABAM1Q9NWV8 329 aa33.18■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 COL18A1P39060 1754 aa33.17■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa33.16■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.16■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 BRINP3Q76B58 766 aa33.15■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.14■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa33.14■■■□□ 2.9
FOXQ1-201ENST00000296839 RGS12O14924 1447 aa33.13■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 ERBB3P21860 1342 aa33.13■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 AMOTQ4VCS5 1084 aa33.12■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM161AQ3B820 660 aa33.12■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 PTPRCP08575 1304 aa33.11■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.1■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCC6O95255 1503 aa33.1■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 MSH5O43196 834 aa33.1■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 C8orf34Q49A92 452 aa33.08■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.08■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC4A2P04920 1241 aa33.08■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 KDM3BQ7LBC6 1761 aa33.08■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.89
FOXQ1-201ENST00000296839 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 LGR6Q9HBX8 967 aa33.07■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 SLAIN2Q9P270 581 aa33.06■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 CACNA1FO60840 1977 aa33.05■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 SMC5Q8IY18 1101 aa33.05■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa33.02■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.02■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 CPDO75976 1380 aa33.02■■■□□ 2.88
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC30Q5VVM6 783 aa33.01■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.01■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 G2E3Q7L622 706 aa33■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 STK31Q9BXU1 1019 aa33■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 C1orf115Q9H7X2 142 aa33■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa32.99■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa32.99■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 RNMTO43148 476 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 NLRP2Q9NX02 1062 aa32.98■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 CHRNA2Q15822 529 aa32.97■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 TEFQ10587 303 aa32.97■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
FOXQ1-201ENST00000296839 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa32.94■■■□□ 2.86
FOXQ1-201ENST00000296839 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
FOXQ1-201ENST00000296839 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms