RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 PTCH1Q13635 1447 aa30.46■■■□□ 2.47
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PKDCC-201ENST00000294964 SIRT1Q96EB6 747 aa30.46■■■□□ 2.47
PKDCC-201ENST00000294964 FCHSD2O94868 740 aa30.46■■■□□ 2.47
PKDCC-201ENST00000294964 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
PKDCC-201ENST00000294964 KCNA6P17658 529 aa30.45■■■□□ 2.47
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.45■■■□□ 2.47
PKDCC-201ENST00000294964 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.44■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 TSPYL6Q8N831 410 aa30.44■■■□□ 2.46
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PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6L22H0YM25 854 aa30.43■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.42■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa30.42■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 KIF2CQ99661 725 aa30.42■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 PRDM10Q9NQV6 1147 aa30.42■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 NWD1Q149M9 1564 aa30.41■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
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PKDCC-201ENST00000294964 IL16Q14005 1332 aa30.4■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 FAM83GA6ND36 823 aa30.4■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF445P59923 1031 aa30.39■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 C1orf115Q9H7X2 142 aa30.39■■■□□ 2.46
PKDCC-201ENST00000294964 DCTN1Q14203 1278 aa30.39■■■□□ 2.46
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PKDCC-201ENST00000294964 PDLIM2Q96JY6 352 aa30.38■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.38■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.37■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 IL13P35225 146 aa30.36■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 NFE2L2Q16236 605 aa30.36■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.36■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 RBSNQ9H1K0 784 aa30.36■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 AK9Q5TCS8 1911 aa30.35■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 SOX12O15370 315 aa30.34■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa30.34■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa30.33■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 LNPKQ9C0E8 428 aa30.33■■■□□ 2.45
PKDCC-201ENST00000294964 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
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PKDCC-201ENST00000294964 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa30.32■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 VAMP4O75379 141 aa30.32■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 COG3Q96JB2 828 aa30.32■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 MBIPQ9NS73 344 aa30.32■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 KIF16BQ96L93 1317 aa30.32■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 ATP7BP35670 1465 aa30.31■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 NCLP19338 710 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
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PKDCC-201ENST00000294964 SASS6Q6UVJ0 657 aa30.3■■■□□ 2.44
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PKDCC-201ENST00000294964 MCTP1Q6DN14 999 aa30.28■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 AEBP1Q8IUX7 1158 aa30.28■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 C8orf58Q8NAV2 365 aa30.28■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 ALDH1L2Q3SY69 923 aa30.27■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PKDCC-201ENST00000294964 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
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PKDCC-201ENST00000294964 NUCB1Q02818 461 aa30.26■■■□□ 2.43
PKDCC-201ENST00000294964 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PKDCC-201ENST00000294964 MCM5P33992 734 aa30.24■■■□□ 2.43
PKDCC-201ENST00000294964 LMBRD1Q9NUN5 540 aa30.24■■■□□ 2.43
PKDCC-201ENST00000294964 KRT24Q2M2I5 525 aa30.23■■■□□ 2.43
PKDCC-201ENST00000294964 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
PKDCC-201ENST00000294964 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
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PKDCC-201ENST00000294964 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.19■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 IFT57Q9NWB7 429 aa30.19■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC39Q9UFE4 941 aa30.18■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
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PKDCC-201ENST00000294964 ZNF853P0CG23 659 aa30.17■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa30.17■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.16■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 MCM10Q7L590 875 aa30.16■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 DLG5Q8TDM6 1919 aa30.15■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa30.15■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
PKDCC-201ENST00000294964 SIRT2Q8IXJ6 389 aa30.15■■■□□ 2.42
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