RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 POLKQ9UBT6 870 aa24.82■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.82■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 NHSQ6T4R5 1651 aa24.82■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 PROM2Q8N271 834 aa24.8■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 NSD2O96028 1365 aa24.8■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.79■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 NBPF14Q5TI25 921 aa24.78■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.78■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.77■■□□□ 1.56
PTX4-201ENST00000293922 NCAPD2Q15021 1401 aa24.76■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 LRP5O75197 1615 aa24.75■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 TXNRD1Q16881 649 aa24.74■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 MORC1Q86VD1 984 aa24.72■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 EYA1Q99502 592 aa24.72■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 BTAF1O14981 1849 aa24.72■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 ANP32CO43423 234 aa24.7■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
PTX4-201ENST00000293922 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.68■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.68■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.68■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.67■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 CYP27B1O15528 508 aa24.66■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 RALBP1Q15311 655 aa24.65■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.65■■□□□ 1.54
PTX4-201ENST00000293922 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.63■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.62■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 PAPPAQ13219 1627 aa24.62■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 SLC15A2Q16348 729 aa24.61■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 MIER1Q8N108 512 aa24.61■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 STK32BQ9NY57 414 aa24.61■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 SPG7Q9UQ90 795 aa24.6■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 CASZ1Q86V15 1759 aa24.59■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.58■■□□□ 1.53
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.57■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.56■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 ZNF827Q17R98 1081 aa24.56■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 SPON1Q9HCB6 807 aa24.55■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 KCNQ4P56696 695 aa24.54■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 LY75O60449 1722 aa24.54■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 PHKG2P15735 406 aa24.53■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 IL13P35225 146 aa24.53■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 MTHFSP49914 203 aa24.53■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.53■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.52■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 AKT1S1Q96B36 256 aa24.52■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 PPP2R1AP30153 589 aa24.52■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.52■■□□□ 1.52
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB7AO95365 584 aa24.51■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 KDRP35968 1356 aa24.5■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 CCER2I3L3R5 266 aa24.5■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 PIGBQ92521 554 aa24.5■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 ITGB4P16144 1822 aa24.48■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 PALLDQ8WX93 1383 aa24.48■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.48■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 PTGER2P43116 358 aa24.46■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.45■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
PTX4-201ENST00000293922 MTFR1LQ9H019 292 aa24.44■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.44■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.43■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.43■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 DCAF5Q96JK2 942 aa24.42■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.42■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.41■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.4■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.4■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.39■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 CCDC184Q52MB2 194 aa24.39■■□□□ 1.5
PTX4-201ENST00000293922 C5P01031 1676 aa24.39■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 HMOX1P09601 288 aa24.38■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 MRS2Q9HD23 443 aa24.37■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.36■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 SIK1P57059 783 aa24.36■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.36■■□□□ 1.49
PTX4-201ENST00000293922 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.36■■□□□ 1.49
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