RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
SNRNP25-201ENST00000293861 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.47■■□□□ 1.99
SNRNP25-201ENST00000293861 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.46■■□□□ 1.99
SNRNP25-201ENST00000293861 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
SNRNP25-201ENST00000293861 KIAA0232Q92628 1395 aa27.46■■□□□ 1.99
SNRNP25-201ENST00000293861 MCM10Q7L590 875 aa27.45■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.45■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.44■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE4AP27815 886 aa27.43■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 BACH2Q9BYV9 841 aa27.43■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.42■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 SKAP1Q86WV1 359 aa27.41■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 PXDNQ92626 1479 aa27.41■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.4■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.4■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 NCAPD2Q15021 1401 aa27.4■■□□□ 1.98
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.39■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.39■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.39■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF4Q96M43 638 aa27.39■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K5Q99683 1374 aa27.38■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.35■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.35■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC4O15439 1325 aa27.34■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCC6O95255 1503 aa27.33■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.33■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 BRINP3Q76B58 766 aa27.33■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.33■■□□□ 1.97
SNRNP25-201ENST00000293861 RGPD5Q99666 1765 aa27.32■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.32■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.31■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.31■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 CACNA1FO60840 1977 aa27.31■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.3■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHG5O94827 1062 aa27.29■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.29■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 RGS3P49796 1198 aa27.28■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 SLAIN2Q9P270 581 aa27.28■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 KRT24Q2M2I5 525 aa27.28■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 ERBB3P21860 1342 aa27.27■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM161AQ3B820 660 aa27.27■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.27■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 IL17REQ8NFR9 667 aa27.27■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 COL18A1P39060 1754 aa27.27■■□□□ 1.96
SNRNP25-201ENST00000293861 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.25■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 MSH5O43196 834 aa27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 CPDO75976 1380 aa27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 PTPRCP08575 1304 aa27.23■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.23■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 RGS12O14924 1447 aa27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 C8orf34Q49A92 452 aa27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.22■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 SMC5Q8IY18 1101 aa27.21■■□□□ 1.95
SNRNP25-201ENST00000293861 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.2■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.19■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.18■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.16■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.16■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.15■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC4A2P04920 1241 aa27.14■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SNRNP25-201ENST00000293861 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 LGR6Q9HBX8 967 aa27.12■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.12■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.11■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.11■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 ABCA3Q99758 1704 aa27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 TEFQ10587 303 aa27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 CHRNA2Q15822 529 aa27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 STK31Q9BXU1 1019 aa27.1■■□□□ 1.93
SNRNP25-201ENST00000293861 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.09■■□□□ 1.93
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