RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266079.4

PRPF6-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF6, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6-201ENST00000266079 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.15■□□□□ 0.18
PRPF6-201ENST00000266079 RTL1A6NKG5 1358 aa16.15■□□□□ 0.18
PRPF6-201ENST00000266079 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PRPF6-201ENST00000266079 PLIN1O60240 522 aa16.14■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.14■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 WWC1Q8IX03 1113 aa16.14■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 USP54Q70EL1 1684 aa16.13■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 RGPD5Q99666 1765 aa16.13■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.13■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 GOLGA2Q08379 1002 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 NFE2L2Q16236 605 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 MCM10Q7L590 875 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 C8orf37Q96NL8 207 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.11■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 CPDO75976 1380 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 FAM161AQ3B820 660 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.1■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
PRPF6-201ENST00000266079 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.08■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 C8orf34Q49A92 452 aa16.08■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.08■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF521Q96K83 1311 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 KDRP35968 1356 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 NGLY1Q96IV0 654 aa16.07■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 JCADQ9P266 1359 aa16.06■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.06■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 ABCA3Q99758 1704 aa16.05■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.05■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 SLFN5Q08AF3 891 aa16.04■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 COL18A1P39060 1754 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 GAS2L2Q8NHY3 880 aa16.03■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PRPF6-201ENST00000266079 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 E9PSI1 815 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 LGR6Q9HBX8 967 aa16.01■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 GNAT3A8MTJ3 354 aa16■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 CCDC27Q2M243 656 aa16■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 MEGF6O75095 1541 aa16■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 C1orf141Q5JVX7 400 aa16■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 A0A0G2JS52 829 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 WDR63Q8IWG1 891 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 IL17REQ8NFR9 667 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.99■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.98■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.98■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 NGEFQ8N5V2 710 aa15.98■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 LRP6O75581 1613 aa15.98■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.97■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 IL2RBP14784 551 aa15.97■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 KRT24Q2M2I5 525 aa15.97■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 DLG5Q8TDM6 1919 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 MAP3K5Q99683 1374 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 CYP27B1O15528 508 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 MBIPQ9NS73 344 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 USP21Q9UK80 565 aa15.96■□□□□ 0.15
PRPF6-201ENST00000266079 CRB1P82279 1406 aa15.96■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 SPG7Q9UQ90 795 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.95■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 RGS3P49796 1198 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.94■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 TEFQ10587 303 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 TSPYL6Q8N831 410 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 EP400Q96L91 3159 aa15.93■□□□□ 0.14
PRPF6-201ENST00000266079 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.2 ms