RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262288.7

SCPEP1-201, Transcript of serine carboxypeptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCPEP1, Length 1,942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1-201ENST00000262288 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.43■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 KRT24Q2M2I5 525 aa20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 NBPF4Q96M43 638 aa20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.42■□□□□ 0.86
SCPEP1-201ENST00000262288 SLIT3O75094 1523 aa20.42■□□□□ 0.86
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SCPEP1-201ENST00000262288 STRCQ7RTU9 1775 aa20.41■□□□□ 0.86
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SCPEP1-201ENST00000262288 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SCPEP1-201ENST00000262288 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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SCPEP1-201ENST00000262288 KIAA0232Q92628 1395 aa20.35■□□□□ 0.85
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SCPEP1-201ENST00000262288 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SCPEP1-201ENST00000262288 MAP3K5Q99683 1374 aa20.34■□□□□ 0.85
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SCPEP1-201ENST00000262288 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.33■□□□□ 0.85
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SCPEP1-201ENST00000262288 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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SCPEP1-201ENST00000262288 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.31■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.31■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.31■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCC4O15439 1325 aa20.31■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 LRRC37A3O60309 1634 aa20.3■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 C8orf34Q49A92 452 aa20.3■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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SCPEP1-201ENST00000262288 LGR6Q9HBX8 967 aa20.27■□□□□ 0.84
SCPEP1-201ENST00000262288 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.26■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.26■□□□□ 0.83
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SCPEP1-201ENST00000262288 SLC4A2P04920 1241 aa20.25■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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SCPEP1-201ENST00000262288 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.23■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.22■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 PTPRCP08575 1304 aa20.22■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 ERBB3P21860 1342 aa20.22■□□□□ 0.83
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SCPEP1-201ENST00000262288 RGS12O14924 1447 aa20.22■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.22■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 CHRNA2Q15822 529 aa20.21■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.21■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.21■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 COL18A1P39060 1754 aa20.21■□□□□ 0.83
SCPEP1-201ENST00000262288 NECTIN2Q92692 538 aa20.2■□□□□ 0.82
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SCPEP1-201ENST00000262288 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.19■□□□□ 0.82
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SCPEP1-201ENST00000262288 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.18■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.18■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 KCNQ3O43525 872 aa20.17■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.17■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.16■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 STK31Q9BXU1 1019 aa20.16■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.15■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 TEFQ10587 303 aa20.15■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.15■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SCPEP1-201ENST00000262288 CACNA1FO60840 1977 aa20.15■□□□□ 0.82
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