RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258100.8

SMYD5-201, Transcript of SMYD family member 5, humanhuman

TSL 5

Gene SMYD5, Length 786 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5-201ENST00000258100 LY75O60449 1722 aa24.16■■□□□ 1.46
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SMYD5-201ENST00000258100 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.16■■□□□ 1.46
SMYD5-201ENST00000258100 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.15■■□□□ 1.46
SMYD5-201ENST00000258100 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SMYD5-201ENST00000258100 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SMYD5-201ENST00000258100 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.453e-6■□□□□ 8.1
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SMYD5-201ENST00000258100 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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SMYD5-201ENST00000258100 NBPF4Q96M43 638 aa24.06■■□□□ 1.44
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SMYD5-201ENST00000258100 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.02■■□□□ 1.44
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SMYD5-201ENST00000258100 CYP27B1O15528 508 aa23.93■■□□□ 1.42
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SMYD5-201ENST00000258100 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.9■■□□□ 1.42
SMYD5-201ENST00000258100 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.89■■□□□ 1.42
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SMYD5-201ENST00000258100 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.87■■□□□ 1.41
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SMYD5-201ENST00000258100 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.82■■□□□ 1.4
SMYD5-201ENST00000258100 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
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SMYD5-201ENST00000258100 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.81■■□□□ 1.4
SMYD5-201ENST00000258100 AK7Q96M32 723 aa23.81■■□□□ 1.4
SMYD5-201ENST00000258100 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SMYD5-201ENST00000258100 ITPK1Q13572 414 aa23.79■■□□□ 1.4
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SMYD5-201ENST00000258100 SSFA2P28290 1259 aa23.73■■□□□ 1.39
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SMYD5-201ENST00000258100 GNPATO15228 680 aa23.71■■□□□ 1.39
SMYD5-201ENST00000258100 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SMYD5-201ENST00000258100 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.7■■□□□ 1.38
SMYD5-201ENST00000258100 SLC24A1O60721 1099 aa23.69■■□□□ 1.38
SMYD5-201ENST00000258100 MMP10P09238 476 aa23.69■■□□□ 1.38
SMYD5-201ENST00000258100 ATG3Q9NT62 314 aa23.69■■□□□ 1.38
SMYD5-201ENST00000258100 PHKG2P15735 406 aa23.68■■□□□ 1.38
SMYD5-201ENST00000258100 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.68■■□□□ 1.38
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