RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000245304.4

RAP2A-201, Transcript of RAP2A, member of RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAP2A, Length 5,487 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP2A-201ENST00000245304 MYL6BP14649 208 aa26.6■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 KIF18AQ8NI77 898 aa26.6■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 USP25Q9UHP3 1055 aa26.6■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 SOGA3Q5TF21 947 aa26.59■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 EZRP15311 586 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 GIMAP7Q8NHV1 300 aa26.58■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
RAP2A-201ENST00000245304 SSFA2P28290 1259 aa26.58■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.58■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 INCENPQ9NQS7 918 aa26.58■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CDKL5O76039 1030 aa26.57■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 DYDC1Q8WWB3 177 aa26.57■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 SMARCA2P51531 1590 aa26.57■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 KLHL10Q6JEL2 608 aa26.57■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CCDC113Q9H0I3 377 aa26.56■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.56■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 SHTN1A0MZ66 631 aa26.56■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.56■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 PRAM1Q96QH2 718 aa26.56■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 TMX1Q9H3N1 280 aa26.56■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 GBP3Q9H0R5 595 aa26.55■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.55■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 ATF3P18847 181 aa26.55■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 TNNT1P13805 278 aa26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 TDO2P48775 406 aa26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 DNA2P51530 1060 aa26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.54■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 KRT32Q14532 448 aa26.53■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa26.53■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 SSR1P43307 286 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 ZSCAN12O43309 604 aa26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 CABP1Q9NZU7 370 aa26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.52■■□□□ 1.84
RAP2A-201ENST00000245304 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.51■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.51■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.51■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.51■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 SPDYE4A6NLX3 237 aa26.5■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 KIF5CO60282 957 aa26.5■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 CASQ1P31415 396 aa26.5■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 ANO10Q9NW15 660 aa26.5■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 GUCY1B3Q02153 619 aa26.5■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 RAI14Q9P0K7 980 aa26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 SLFN5Q08AF3 891 aa26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 CPLX3Q8WVH0 158 aa26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.49■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 IDH1O75874 414 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.48■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.48■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 SPA17Q15506 151 aa26.48■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.48■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 TICAM2Q86XR7 235 aa26.48■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa26.47■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.47■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 STRN4Q9NRL3 753 aa26.47■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 MX1P20591 662 aa26.45■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
RAP2A-201ENST00000245304 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 CABP4P57796 275 aa26.44■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 MAP9Q49MG5 647 aa26.44■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 LUZP1Q86V48 1076 aa26.44■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.44■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.44■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 AFAP1Q8N556 730 aa26.43■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 USP5P45974 858 aa26.43■■□□□ 1.82
RAP2A-201ENST00000245304 CDK19Q9BWU1 502 aa26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.7 ms