RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.22■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.22■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.22■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 FLT4P35916 1363 aa23.22■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 ABCA3Q99758 1704 aa23.22■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 TRIM27P14373 513 aa23.21■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.21■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 KIAA0232Q92628 1395 aa23.21■■□□□ 1.31
USP18-201ENST00000215794 BCL11AQ9H165 835 aa23.2■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 FAM83GA6ND36 823 aa23.19■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 RGPD5Q99666 1765 aa23.19■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.18■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 HSPA1LP34931 641 aa23.17■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.17■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 DCTN1Q14203 1278 aa23.16■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 IP6K1Q92551 441 aa23.16■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 C8orf34Q49A92 452 aa23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 AAMPQ13685 434 aa23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 TSPYL6Q8N831 410 aa23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 MBIPQ9NS73 344 aa23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 IFT57Q9NWB7 429 aa23.15■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 ZNF853P0CG23 659 aa23.14■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.14■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.14■■□□□ 1.3
USP18-201ENST00000215794 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.14■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 FAM161AQ3B820 660 aa23.14■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 GNAI1P63096 354 aa23.13■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 ADAMTS2O95450 1211 aa23.12■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.12■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 RTL1A6NKG5 1358 aa23.12■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.12■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.12■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 VAMP4O75379 141 aa23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 KIF16BQ96L93 1317 aa23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 EYA1Q99502 592 aa23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 COL18A1P39060 1754 aa23.11■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.1■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 CFAP44Q96MT7 982 aa23.09■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 CPDO75976 1380 aa23.09■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.09■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
USP18-201ENST00000215794 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.08■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 NBPF4Q96M43 638 aa23.08■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.08■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.07■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.06■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.06■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 ERBB3P21860 1342 aa23.05■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 MCM10Q7L590 875 aa23.05■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 ZNF428Q96B54 188 aa23.05■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 STRN4Q9NRL3 753 aa23.04■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 JCADQ9P266 1359 aa23.04■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.03■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.03■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.03■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.02■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 BTG4Q9NY30 223 aa23.02■■□□□ 1.28
USP18-201ENST00000215794 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.01■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 KRT24Q2M2I5 525 aa23■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 LRP6O75581 1613 aa22.99■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 KDRP35968 1356 aa22.98■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 USP35Q9P2H5 1018 aa22.97■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 CHL1O00533 1208 aa22.96■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 C8orf37Q96NL8 207 aa22.96■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 EVA1CP58658 441 aa22.96■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.96■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 CRB1P82279 1406 aa22.96■■□□□ 1.27
USP18-201ENST00000215794 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.95■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.95■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 ABCC6O95255 1503 aa22.94■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 SEC24BO95487 1268 aa22.94■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 ABCC4O15439 1325 aa22.93■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.93■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.93■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms