RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.26■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.25■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.25■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.25■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 DEPDC5O75140 1603 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 CPA1P15085 419 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.24■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 NUCB2P80303 420 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 TMX3Q96JJ7 454 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.23■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 ERC2O15083 957 aa21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
KCNQ1-201ENST00000155840 ANXA1P04083 346 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF853P0CG23 659 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.2■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 PDE1AP54750 535 aa21.19■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.19■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.19■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 ZMYM3Q14202 1370 aa21.19■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.19■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 IL25Q9H293 177 aa21.19■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 REC8O95072 547 aa21.18■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.18■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.17■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.17■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.17■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 ADGRB2O60241 1585 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 UQCRHP07919 91 aa21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCC3O15438 1527 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 RTL1A6NKG5 1358 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.15■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.14■□□□□ 0.98
KCNQ1-201ENST00000155840 FIBPO43427 364 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 PPLO60437 1756 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 SPG7Q9UQ90 795 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 USP25Q9UHP3 1055 aa21.13■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 AMPHP49418 695 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 STK31Q9BXU1 1019 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPRMP28827 1452 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 HMMRO75330 724 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.12■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 IFT172Q9UG01 1749 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.11■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 MX1P20591 662 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 PTCH1Q13635 1447 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.1■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 METP08581 1390 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 OFD1O75665 1012 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 GNAI2P04899 355 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 USP48Q86UV5 1035 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 SPC24Q8NBT2 197 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.09■□□□□ 0.97
KCNQ1-201ENST00000155840 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms