RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 MPOP05164 745 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 SLC2A4P14672 509 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A6P19224 532 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A1P22309 533 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A4P22310 534 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A3P35503 534 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A5P35504 534 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 GABREP78334 506 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 SNX1Q13596 522 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 PTPRCAPQ14761 206 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 INSCQ1MX18 579 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 RTP4Q96DX8 246 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 TLR10Q9BXR5 811 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A7Q9HAW7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A10Q9HAW8 530 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 UGT1A8Q9HAW9 530 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 KLC4Q9NSK0 619 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 RAXQ9Y2V3 346 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa22.09■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 CHUKO15111 745 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 BRINP1O60477 761 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 FGGP02679 453 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 AMZ1Q400G9 498 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 KCTD11Q693B1 232 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 CCDC89Q8N998 374 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 ZNF398Q8TD17 642 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 TMEM74Q96NL1 305 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 STRADBQ9C0K7 418 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SYT6-210ENST00000641643 USP27XA6NNY8 438 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 PRAMEF1O95521 474 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 AP2A1O95782 977 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 HADHAP40939 763 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 GPR3P46089 330 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 LSSP48449 732 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 LMAN1P49257 510 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 C3orf38Q5JPI3 329 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 LINC00523Q86TU6 105 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 SFRP1Q8N474 314 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 ASB8Q9H765 288 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 OR5K4A6NMS3 321 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 E7EVH7 732 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 CEP104O60308 925 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 VCLP18206 1134 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 FDFT1P37268 417 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 INHBCP55103 352 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 OR1D5P58170 312 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 B4GALNT1Q00973 533 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 CCNG2Q16589 344 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 MAP9Q49MG5 647 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 SLC37A2Q8TED4 501 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 SLC38A3Q99624 504 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 FKBPLQ9UIM3 349 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 SATB2Q9UPW6 733 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 KCTD3Q9Y597 815 aa22.07■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 PPM1DO15297 605 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 GPR39O43194 453 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 B4GAT1O43505 415 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 CPNE6O95741 557 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 F3P13726 295 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 FASLGP48023 281 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 CLCNKAP51800 687 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 PDX1P52945 283 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 NR1D2Q14995 579 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 ZNF438Q7Z4V0 828 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 PIM3Q86V86 326 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 FGF11Q92914 225 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.06■■□□□ 1.12
SYT6-210ENST00000641643 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms