RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 TMEM236Q5W0B7 351 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SCIMPQ6UWF3 145 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 NUDT8Q8WV74 236 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PRSS23O95084 383 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CDH1P12830 882 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 GEMP55040 296 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 INAQ16352 499 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 GLYATQ6IB77 296 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SIK2Q9H0K1 926 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.35■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CCNCP24863 283 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 HTR1EP28566 365 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.853e-9■■■■■ 32.4
PMS1-222ENST00000639501 LAPTM5Q13571 262 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CARTPTQ16568 116 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 ADPRMQ3LIE5 342 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SCML4Q8N228 414 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CDCA5Q96FF9 252 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SMOQ99835 787 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PTGES3LE9PB15 166 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 MTHFRP42898 656 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CXCR3P49682 368 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SPATS1Q496A3 300 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 BTBD2Q9BX70 525 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SLC39A8Q9C0K1 460 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 RNF39Q9H2S5 420 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TPK1Q9H3S4 243 aa20.34■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CCDC154A6NI56 674 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CYBBP04839 570 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TAF6P49848 677 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 MTPNP58546 118 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP1Q07960 439 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 FXNQ16595 210 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 NKG7Q16617 165 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 WSCD1Q658N2 575 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TAC4Q86UU9 113 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 ABI1Q8IZP0 508 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 TMEM199Q8N511 208 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 VMP1Q96GC9 406 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 AIG1Q9NVV5 245 aa20.33■□□□□ 0.85
PMS1-222ENST00000639501 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 30.3
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PMS1-222ENST00000639501 DYTNA2CJ06 578 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 S1PR4O95977 384 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ALOX5P09917 674 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 WNT3AP56704 352 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 VGLL4Q14135 290 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ZNF549Q6P9A3 640 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 CTRCQ99895 268 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 HGH1Q9BTY7 390 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.33■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 NDUFS2O75306 463 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 KCNAB2Q13303 367 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 ZNF560Q96MR9 790 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 EHD1Q9H4M9 534 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 RGS18Q9NS28 235 aa20.32■□□□□ 0.84
PMS1-222ENST00000639501 KCTD3Q9Y597 815 aa20.32■□□□□ 0.84
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