RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TBATAQ96M53 351 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MBOAT7Q96N66 472 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ABCD2Q9UBJ2 740 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HLA-DPB1P04440 258 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GKN3PP0CG01 181 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PRDX5P30044 214 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PLIN5Q00G26 463 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GPAT3Q53EU6 434 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PARP8Q8N3A8 854 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OXR1Q8N573 874 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF527Q8NB42 609 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR4C6Q8NH72 309 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NCSTNQ92542 709 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC46Q96FV0 321 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PFDN5Q99471 154 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 LHX5Q9H2C1 402 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TPP1O14773 563 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ANGPTL1O95841 491 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CSF1RP07333 972 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RBBP4Q09028 425 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ADAM15Q13444 863 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 COLEC12Q5KU26 742 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 HPS6Q86YV9 775 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 Q8N402 240 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF709Q8N972 641 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR2L5Q8NG80 312 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NAT14Q8WUY8 206 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SEMA4AQ9H3S1 761 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KLQ9UEF7 1012 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 POU6F1Q14863 301 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GNASQ5JWF2 1037 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 BAP1Q92560 729 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ENY2Q9NPA8 101 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CLDN11O75508 207 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TGM6O95932 706 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM163BP0C2L3 166 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CTSEP14091 401 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PAX7P23759 505 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ERVK-24P63145 666 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ECT2LQ008S8 904 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CD47Q08722 323 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 UBQLNLQ8IYU4 475 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PTTG3PQ9NZH4 202 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 UGT1A3P35503 534 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MAGEA12P43365 314 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC1A5Q15758 541 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 USP30Q70CQ3 517 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PIGBQ92521 554 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TXN2Q99757 166 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TM9SF2Q99805 663 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 UNC13BO14795 1591 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SASH3O75995 380 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 RAP2AP10114 183 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GLP1RP43220 463 aa6.32□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TSPAN5P62079 268 aa6.32□□□□□ -1.4
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