RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	HDAC8	Q9BY41	377 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SMOX	Q9NWM0	555 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	MED16	Q9Y2X0	877 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC189	A1A4V9	331 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	NIPSNAP2	O75323	286 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ADRB3	P13945	408 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CD1D	P15813	335 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	TFEB	P19484	476 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	PSMD8	P48556	350 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	LIPI	Q6XZB0	460 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	DERL2	Q9GZP9	239 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		27.57	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SBK3	P0C264	359 aa		27.56	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SLC1A6	P48664	564 aa		27.56	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SDE2	Q6IQ49	451 aa		27.56	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		27.56	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	MACC1	Q6ZN28	852 aa		27.56	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	WNT16	Q9UBV4	365 aa		27.56	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151		K7EQS6	105 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ACOX1	Q15067	660 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	IER5L	Q5T953	404 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151		Q6ZVL8	140 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	FAM136A	Q96C01	138 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CD84	Q9UIB8	345 aa		27.55	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	WNT9A	O14904	365 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	AREL1	O15033	823 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ADH1B	P00325	375 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	TIE1	P35590	1138 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ETV3	P41162	512 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CD200R1	Q8TD46	325 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	BOC	Q9BWV1	1114 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	FBRS	Q9HAH7	460 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	NPHS2	Q9NP85	383 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	DHRS7	Q9Y394	339 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	NCOR1	O75376	2440 aa		27.54	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CFAP99	D6REC4	459 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	NEMP1	O14524	444 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	DRD1	P21728	446 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	LIG3	P49916	1009 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SEC13	P55735	322 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	DNAJB13	P59910	316 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	IL2	P60568	153 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	27.53	■■■□□ 2	2e-6	■■■■■ 42.3
BRF1-221	ENST00000619151	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ISCA2	Q86U28	154 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	PANX3	Q96QZ0	392 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ALG9	Q9H6U8	611 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	PLXNA2	O75051	1894 aa		27.53	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SHISA7	A6NL88	538 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	DLX3	O60479	287 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SMIM24	O75264	130 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	NTSR1	P30989	418 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	WAS	P42768	502 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	METAP1	P53582	386 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	OVGP1	Q12889	678 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	STARD3	Q14849	445 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	INPP5D	Q92835	1189 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ITM2B	Q9Y287	266 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	BPTF	Q12830	3046 aa		27.52	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	ZBTB14	O43829	449 aa		27.51	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	27.51	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CA5A	P35218	305 aa		27.51	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	SERPINB5	P36952	375 aa		27.51	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	CLCN7	P51798	805 aa		27.51	■■■□□ 2
BRF1-221	ENST00000619151	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	27.51	■■■□□ 2

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