RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606352.1

RNU6-90P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 90, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-90P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-90P-201ENST00000606352 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 WLSQ5T9L3 541 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ARHGEF16Q5VV41 709 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 FRG2Q64ET8 278 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 C17orf99Q6UX52 265 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAB11FIP2Q7L804 512 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 LONP2Q86WA8 852 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 GATAD2AQ86YP4 633 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 KIAA2013Q8IYS2 634 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 FSIP1Q8NA03 581 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SUMF1Q8NBK3 374 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 RDM1Q8NG50 284 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2T11Q8NH01 316 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF721Q8TF20 911 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 STYXQ8WUJ0 223 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 HPSE2Q8WWQ2 592 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TOMM40LQ969M1 308 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TMEM143Q96AN5 459 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 PHF21AQ96BD5 680 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 EID2BQ96D98 161 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 RNFT2Q96EX2 444 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 GRAMD2BQ96HH9 432 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF577Q9BSK1 485 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 RTKNQ9BST9 563 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TEX13BQ9BXU2 312 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 NDST4Q9H3R1 872 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 VEZTQ9HBM0 779 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 NOD2Q9HC29 1040 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAGEE1Q9HCI5 957 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TRPC7Q9HCX4 862 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 PANK4Q9NVE7 773 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 DACT1Q9NYF0 836 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 KCND3Q9UK17 655 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 KLHL20Q9Y2M5 609 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ITGB4P16144 1822 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 A0A087WWV3 80 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SHISA7A6NL88 538 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 AQP12BA6NM10 295 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 HAT1O14929 419 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 HDAC3O15379 428 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SPINT2O43291 252 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 NXPH2O95156 264 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSPG5O95196 566 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 LY6G6DO95868 133 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 FTCDO95954 541 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 HPRP00739 348 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 FDPSP14324 419 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC2A4P14672 509 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TNFSF4P23510 183 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAPK9P45984 424 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 GSDMDP57764 484 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TAS2R38P59533 333 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 COG7P83436 770 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TLE4Q04727 773 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 FOXM1Q08050 763 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 PDCLQ13371 301 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 PTK2BQ14289 1009 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF79Q15937 498 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 DUOXA1Q1HG43 343 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 EDRF1Q3B7T1 1238 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ZNF766Q5HY98 468 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 GGNBP1Q5YKI7 109 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 OLFML2AQ68BL7 652 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 IGFL2Q6UWQ7 119 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 PACS1Q6VY07 963 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 Q75L30 129 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ATG9AQ7Z3C6 839 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 C11orf96Q7Z7L8 435 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 DPP9Q86TI2 863 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ISCA2Q86U28 154 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 TSPAN33Q86UF1 283 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC35F3Q8IY50 421 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 CPXM2Q8N436 756 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 OR2T12Q8NG77 320 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 STAG1Q8WVM7 1258 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 SLC44A1Q8WWI5 657 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 CENPTQ96BT3 561 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 ORAI1Q96D31 301 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-90P-201ENST00000606352 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms