RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591376.5

CIRBP-232, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 830 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-232ENST00000591376 GPR89AB7ZAQ6 455 aa18.11■□□□□ 0.49
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CIRBP-232ENST00000591376 TMEM26Q6ZUK4 368 aa18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-232ENST00000591376 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CIRBP-232ENST00000591376 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
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