RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 COX4I1P13073 169 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 FDXRP22570 491 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 VHLP40337 213 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 GLRBP48167 497 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRF1Q5T601 910 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 KDELC2Q7Z4H8 507 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MFN1Q8IWA4 741 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6P1Q8NGX9 317 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 GIMAP7Q8NHV1 300 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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CAPNS1-204ENST00000587718 THTPAQ9BU02 230 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 BATF3Q9NR55 127 aa25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.29■■□□□ 1.64
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CAPNS1-204ENST00000587718 F7P08709 466 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MESP2Q0VG99 397 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 DMC1Q14565 340 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC6Q16204 474 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP68Q76N32 757 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM1BQ8NB78 822 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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CAPNS1-204ENST00000587718 MYEOVQ96EZ4 313 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 HHIPQ96QV1 700 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC7A8Q9UHI5 535 aa25.28■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
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CAPNS1-204ENST00000587718 RGSL1A5PLK6 1076 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MUSKO15146 869 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 INSIG1O15503 277 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RHOCP08134 193 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CD9P21926 228 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CSRP2Q16527 193 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 IL31Q6EBC2 164 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 WDR60Q8WVS4 1066 aa25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-204ENST00000587718 L3HYPDHQ96EM0 354 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 EBF1Q9UH73 591 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-204ENST00000587718 CSHL1Q14406 222 aa25.27■■□□□ 1.64
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CAPNS1-204ENST00000587718 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 AFTPHQ6ULP2 937 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 OTUB2Q96DC9 234 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 C19orf43Q9BQ61 176 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS28Q9UK41 221 aa25.27■■□□□ 1.64
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC166P0CW27 439 aa25.26■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF460Q14592 562 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 KBTBD6Q86V97 674 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 C12orf40Q86WS4 652 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4L1Q8NH43 312 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 FBXO27Q8NI29 283 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 LOXL4Q96JB6 756 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 TBATAQ96M53 351 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 CATSPERZQ9NTU4 200 aa25.26■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 AXIN1O15169 862 aa25.25■■□□□ 1.63
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB14O43829 449 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 GREM1O60565 184 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 GOT2P00505 430 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 IMPDH1P20839 514 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 INHBCP55103 352 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 AP2B1P63010 937 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF789Q5FWF6 425 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 LY6G5CQ5SRR4 150 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 SFTPA1Q8IWL2 248 aa25.25■■□□□ 1.63
CAPNS1-204ENST00000587718 OR7D4Q8NG98 312 aa25.25■■□□□ 1.63
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