RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	SLC7A5	Q01650	507 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CACNG1	Q06432	222 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	BBS9	Q3SYG4	887 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB124	Q8NES8	71 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CARD6	Q9BX69	1037 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SLC32A1	Q9H598	525 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SMOX	Q9NWM0	555 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		24.67	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SMAP	O00193	183 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	BANF1	O75531	89 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DET1	Q7L5Y6	550 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GKN2	Q86XP6	184 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PDIK1L	Q8N165	341 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NXPE1	Q8N323	547 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A45	Q8N413	288 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	MFSD3	Q96ES6	412 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RTKN	Q9BST9	563 aa		24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	24.66	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GRID2	O43424	1007 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	VEGFD	O43915	354 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	FUCA1	P04066	466 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RALB	P11234	206 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PAM	P19021	973 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ARL4C	P56559	192 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	HIF1A	Q16665	826 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GPR33	Q49SQ1	333 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PEX13	Q92968	403 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PWWP2A	Q96N64	755 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	KIFC1	Q9BW19	673 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CLPB	Q9H078	707 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RMI1	Q9H9A7	625 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	WHRN	Q9P202	907 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	BPTF	Q12830	3046 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		24.65	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NUAK1	O60285	661 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC6	O75061	913 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	ACP5	P13686	325 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	INSC	Q1MX18	579 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PYCR3	Q53H96	274 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	OR4L1	Q8NH43	312 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	COPS8	Q99627	209 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	TREX1	Q9NSU2	369 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	NLGN3	Q9NZ94	848 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		24.64	■■□□□ 1.54
GPS1-223	ENST00000584229	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	OR2AG2	A6NM03	316 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP99	D6REC4	459 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ACRV1	P26436	265 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	FOXN2	P32314	431 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	MAGEA3	P43357	314 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ACVR1	Q04771	509 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	DUPD1	Q68J44	220 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	NAT14	Q8WUY8	206 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TTC1	Q99614	292 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	24.63	■■□□□ 1.53
GPS1-223	ENST00000584229	ESYT3	A0FGR9	886 aa		24.62	■■□□□ 1.53

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