RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 CREB1P16220 341 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PGAM1P18669 254 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CALB2P22676 271 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 RBL1P28749 1068 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MAP2K2P36507 400 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 RGS2P41220 211 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MAGEA3P43357 314 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 RAB27AP51159 221 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 HDAC4P56524 1084 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PER3P56645 1201 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 LILRA4P59901 499 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 NCALDP61601 193 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SCAPQ12770 1279 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ASPHQ12797 758 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC153Q494R4 210 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 GRTP1Q5TC63 336 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 METTL21CQ5VZV1 264 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 AFMIDQ63HM1 303 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 Q6ZVL8 140 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 OTOAQ7RTW8 1153 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 METTL23Q86XA0 190 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CEP57Q86XR8 500 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 NUDCD3Q8IVD9 361 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 C4orf33Q8N1A6 199 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PQLC1Q8N2U9 271 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TEX9Q8N6V9 391 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PQLC3Q8N755 202 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PPM1NQ8N819 430 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PPP4R1Q8TF05 950 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SOCS4Q8WXH5 440 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 UROC1Q96N76 676 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MRI1Q9BV20 369 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TLE6Q9H808 572 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 DCLRE1BQ9H816 532 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CAAP1Q9H8G2 361 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 LRRC40Q9H9A6 602 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SETD4Q9NVD3 440 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 THAP1Q9NVV9 213 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 FNIP2Q9P278 1114 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 SCOCQ9UIL1 159 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CDH9Q9ULB4 789 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 FZD10Q9ULW2 581 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRM-215ENST00000583289 OTOFQ9HC10 1997 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 A0A1B0GTW7 788 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 FAM159BA6NKW6 160 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 TRIM49D1C9J1S8 452 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 F8W8V4 182 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 CYB561D2O14569 222 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 GABRDO14764 452 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 GYG2O15488 501 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 TIMM44O43615 452 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRM-215ENST00000583289 POMCP01189 267 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 THP07101 528 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 CD48P09326 243 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 PDGFRBP09619 1106 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF286BP0CG31 522 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 RAP2AP10114 183 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 SLC2A3P11169 496 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 CCDC130P13994 396 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 LMO1P25800 156 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 GCKP35557 465 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 RGS7P49802 495 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-215ENST00000583289 NEK3P51956 506 aa4.58□□□□□ -1.68
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