RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIM3Q86V86 326 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC46A1Q96NT5 459 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPYSL5Q9BPU6 564 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 FICDQ9BVA6 458 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL26Q9NPH9 171 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASCL3Q9NQ33 180 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.9■□□□□ 0.3
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0G2JNG1 304 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf81A6NN90 581 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLD2O14939 933 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 AGTP01019 485 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGA2BP08514 1039 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACP5P13686 325 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCG1P45844 678 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPLD1P80108 840 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIR2DS5Q14953 304 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARP6Q2NL67 630 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAP9Q49MG5 647 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LDLRAP1Q5SW96 308 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC35B2Q8TB61 432 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PATE1Q8WXA2 126 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALS2CR12Q96Q35 445 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIMM29Q9BSF4 260 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 BPIFA1Q9NP55 256 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 A6NCN8 305 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 B4GAT1O43505 415 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK14O94921 469 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRTAMO95727 393 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 F3P13726 295 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH4A1P30038 563 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 GTF2H3Q13889 308 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 P3H1Q32P28 736 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 IYDQ6PHW0 289 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC8AQ8IWT6 810 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC37A2Q8TED4 501 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC25Q96NG3 672 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBL1YQ9BQ87 522 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMOXQ9NWM0 555 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNK6Q9Y257 313 aa16.88■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDRT15L2A8MXV6 281 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPM1DO15297 605 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMD3O43242 534 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNJ13O60928 360 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 VCLP18206 1134 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 STIP1P31948 543 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR1D5P58170 312 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 HHEXQ03014 270 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 INSCQ1MX18 579 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLEC14AQ86T13 490 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC9B2Q86UD5 537 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDHD1Q8NEL9 900 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 GDAP1Q8TB36 358 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 RTP4Q96DX8 246 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 CMKLR1Q99788 373 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC40Q9H9A6 602 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARFGAP3Q9NP61 516 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLC4Q9NSK0 619 aa16.87■□□□□ 0.29
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms