RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 SLC4A1P02730 911 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CSF2P04141 144 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ZNF30P17039 623 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CKMT2P17540 419 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 HTR1BP28222 390 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TRIM23P36406 574 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CHRNA4P43681 627 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 STC1P52823 247 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PPARDQ03181 441 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 MTM1Q13496 603 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CDKN3Q16667 212 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 LCE3BQ5TA77 95 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 KCTD16Q68DU8 428 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 KDELC1Q6UW63 502 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PARGQ86W56 976 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 HID1Q8IV36 788 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 LMX1AQ8TE12 382 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 AP2M1Q96CW1 435 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 EID2BQ96D98 161 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 AGAP2Q99490 1192 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TLR10Q9BXR5 811 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 NOTCH2Q04721 2471 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PSMD11O00231 422 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TRIM38O00635 465 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TOR1BO14657 336 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 AURKAO14965 403 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ZSCAN12O43309 604 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CEP104O60308 925 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GCATO75600 419 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 STK10O94804 968 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GP1BBP13224 206 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 MYF5P13349 255 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CTSEP14091 401 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 COL8A1P27658 744 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PSMB4P28070 264 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GPR1P46091 355 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GEMP55040 296 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GDF10P55107 478 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 RAB15P59190 212 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SRP54P61011 504 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 MPP3Q13368 585 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 OLIG2Q13516 323 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SPARCL1Q14515 664 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PRPSAP1Q14558 356 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 NFATC4Q14934 902 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SLC14A2Q15849 920 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ALG11Q2TAA5 492 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 MACC1Q6ZN28 852 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 TMC3Q7Z5M5 1100 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 WDR92Q96MX6 357 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SPATA13Q96N96 652 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 LYSMD1Q96S90 227 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 APOL2Q9BQE5 337 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GORASP1Q9BQQ3 440 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 FICDQ9BVA6 458 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 DPH1Q9BZG8 443 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GPR63Q9BZJ6 419 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 GBA3Q9H227 469 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 CARD9Q9H257 536 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 WDR26Q9H7D7 661 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-217ENST00000550044 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms