RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 PSMC3P17980 439 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ACRV1P26436 265 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZNF234Q14588 700 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CLEC6AQ6EIG7 209 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CHPFQ8IZ52 775 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LSMEM2Q8N112 164 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TERB1Q8NA31 727 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KCNJ9Q92806 393 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SKA1Q96BD8 255 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CDH19Q9H159 772 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CLEC1BQ9P126 229 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KNL1Q8NG31 2342 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 INPP4BO15327 924 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 C1SP09871 688 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LAMP2P13473 410 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TCF3P15923 654 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TIMP2P16035 220 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SPINT3P49223 89 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 AGTR2P50052 363 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PRKAA2P54646 552 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SEC13P55735 322 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ARHGAP8P85298 464 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ACOX1Q15067 660 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 GAB4Q2WGN9 574 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 NXPE1Q8N323 547 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MARK4Q96L34 752 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 OR52B2Q96RD2 323 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 COPS8Q99627 209 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CD274Q9NZQ7 290 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 OR2AG2A6NM03 316 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TMEM114B3SHH9 223 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 DCXO43602 365 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ATP6AP2O75787 350 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 KAT7O95251 611 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ELFN1P0C7U0 828 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MTHFD2P13995 350 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 CREB5Q02930 508 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 ASPHQ12797 758 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PRKAA1Q13131 559 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PDGFRLQ15198 375 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TMEM198Q66K66 360 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TREML1Q86YW5 311 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SUSD6Q92537 303 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 LYSMD1Q96S90 227 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-215ENST00000549143 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 ECI2O75521 394 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 FSBPO95073 299 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 TSPAN12O95859 305 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 POU2F2P09086 479 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 OPRD1P41143 372 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 IL12RB1P42701 662 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 MAGEA9P43362 315 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 SUOXP51687 545 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CLCN7P51798 805 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 C2orf27AQ580R0 203 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CUZD1Q86UP6 607 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-215ENST00000549143 CPA6Q8N4T0 437 aa8.33□□□□□ -1.08
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