RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	SLC6A18	Q96N87	628 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	VPS18	Q9P253	973 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	OR1A2	Q9Y585	309 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		11.77	□□□□□ -0.52
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM131	Q92545	1883 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	AGAP14	A8MT82	685 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658		E5RI56	91 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	HR	O43593	1189 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	VEGFD	O43915	354 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	MTX2	O75431	263 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	SOD1	P00441	154 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	OR56A5	P0C7T3	313 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	MAOB	P27338	520 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	CD38	P28907	300 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	SLC12A2	P55011	1212 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	C21orf59	P57076	290 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1024L	P59773	190 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	CASP8	Q14790	479 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	NFATC4	Q14934	902 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PLK5	Q496M5	336 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PACS1	Q6VY07	963 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM74	Q86UV6	250 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	GPATCH11	Q8N954	259 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	NELL1	Q92832	810 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	RBBP8	Q99708	897 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TEX101	Q9BY14	249 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	EBF2	Q9HAK2	575 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.77	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	POM121B	A6NF01	834 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658		H0Y8X5	98 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658		H3BMM5	538 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	RASGRF2	O14827	1237 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	CDH16	O75309	829 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PIAS1	O75925	651 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	KRT37	O76014	449 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	KRT38	O76015	456 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	CDK14	O94921	469 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	FTH1	P02794	183 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	SHBG	P04278	402 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	THEGL	P0DJG4	465 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53	4e-7	■■■□□ 18.7
DDB1-223	ENST00000543658	CNTF	P26441	200 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM23	P36406	574 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	PI4KA	P42356	2102 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	OVGP1	Q12889	678 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TMED2	Q15363	201 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZSR6	202 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	DET1	Q7L5Y6	550 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	IQCH	Q86VS3	1027 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DDB1-223	ENST00000543658	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		11.76	□□□□□ -0.53

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