RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 TDRPQ86YL5 185 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 MZB1Q8WU39 189 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 GLYATL1Q969I3 302 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SPACA7Q96KW9 195 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 BMFQ96LC9 184 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 BIRC8Q96P09 236 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 TCF12Q99081 682 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PAFAH2Q99487 392 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RTKNQ9BST9 563 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 BOCQ9BWV1 1114 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 LGR4Q9BXB1 951 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ASB8Q9H765 288 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 FZD3Q9NPG1 666 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ZFATQ9P243 1243 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PLAAQ9Y263 795 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.75□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1W2PR77 199 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PRR19A6NJB7 356 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 H0Y8X5 98 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SLC30A4O14863 429 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 OR1I1O60431 355 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 MTX2O75431 263 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 HAUS5O94927 633 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 FUCA1P04066 466 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PCCBP05166 539 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PYGLP06737 847 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CNR2P34972 360 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 GP5P40197 560 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ABCG1P45844 678 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 TTPAP49638 278 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 LIMK2P53671 638 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CLDN2P57739 230 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 KIAA1024LP59773 190 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CSRP2Q16527 193 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CNSTQ6PJW8 725 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CEP68Q76N32 757 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM74Q86UV6 250 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RBFAQ8N0V3 343 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PPM1NQ8N819 430 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CALML6Q8TD86 181 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 NETO1Q8TDF5 533 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 NAT14Q8WUY8 206 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CDKL2Q92772 493 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 FOXJ1Q92949 421 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ISL2Q96A47 359 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ULK4Q96C45 1275 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SLC6A18Q96N87 628 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ZIM3Q96PE6 472 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 COPS8Q99627 209 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RBBP8Q99708 897 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CPNE1Q99829 537 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 RHOJQ9H4E5 214 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 WDR26Q9H7D7 661 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PPCSQ9HAB8 311 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 GULP1Q9UBP9 304 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 LGALS13Q9UHV8 139 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
C16orf62-211ENST00000540101 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms