RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 MYO19Q96H55 970 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 BIRC8Q96P09 236 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 MYADMQ96S97 322 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.1■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 MAPK8P45983 427 aa20.1■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ECT2LQ008S8 904 aa20.1■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 DMC1Q14565 340 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 VITQ6UXI7 678 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 RNF112Q9ULX5 631 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 AHI1Q8N157 1196 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 STK40Q8N2I9 435 aa20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 KYQ8NBH2 561 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa20.09■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.08■□□□□ 0.81
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PACSIN3-211ENST00000539589 CTPS1P17812 591 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC6A11P48066 632 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NUDT2P50583 147 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SESN3P58005 492 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CACNG1Q06432 222 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PELI3Q8N2H9 469 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MARK4Q96L34 752 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 OBP2AQ9NY56 170 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.08■□□□□ 0.8
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PACSIN3-211ENST00000539589 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.08■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SYCE1LA8MT33 242 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TULP3O75386 442 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ADH1CP00326 375 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 DGKGP49619 791 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 AP2B1P63010 937 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 XIAPP98170 497 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CHSY3Q70JA7 882 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.07■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.07■□□□□ 0.8
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