RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 SEL1L2Q5TEA6 688 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 NLRP8Q86W28 1048 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TXLNBQ8N3L3 684 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 RCBTB1Q8NDN9 531 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TBL1YQ9BQ87 522 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TSGA10Q9BZW7 698 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ZMYND15Q9H091 742 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 GRPEL1Q9HAV7 217 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 IL17CQ9P0M4 197 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM9Q9P0T7 183 aa10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 STX7O15400 261 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 NUAK1O60285 661 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ANXA9O76027 345 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 IFNB1P01574 187 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PYGLP06737 847 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC175P0C221 793 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 HLA-DPA1P20036 260 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 SPAM1P38567 509 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PRPSAP1Q14558 356 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 RPS6KA1Q15418 735 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 INSCQ1MX18 579 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 MAP9Q49MG5 647 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 SNAP47Q5SQN1 464 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 GLIS1Q8NBF1 620 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC35B2Q8TB61 432 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.69□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 RGSL1A5PLK6 1076 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 OR2AG2A6NM03 316 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ITIH1P19827 911 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 HMGCLP35914 325 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CTSCP53634 463 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 INHBCP55103 352 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 DCDC1P59894 354 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 SEPT6Q14141 434 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 MEI1Q5TIA1 1274 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 DENND5AQ6IQ26 1287 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 RANBP10Q6VN20 620 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF547Q8IVP9 402 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 FERMT1Q9BQL6 677 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 VPS18Q9P253 973 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 LHX6Q9UPM6 363 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PKP3Q9Y446 797 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 LAMA5O15230 3695 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 C5orf60A6NFR6 353 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 LIASO43766 372 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CDK14O94921 469 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TNFSF15O95150 251 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 EPOP01588 193 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CSF2RBP32927 897 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ETV5P41161 510 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CFHR1Q03591 330 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC38Q502W7 563 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 JAMLQ86YT9 394 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC112Q8NEF3 446 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CARD9Q9H257 536 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PISDQ9UG56 409 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 APPL1Q9UKG1 709 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PSMD13Q9UNM6 376 aa10.68□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 A8MU76 341 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 TCEA3O75764 348 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 PRAMEF1O95521 474 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 CD1CP29017 333 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 AKT1P31749 480 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 ACTN2P35609 894 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 GRIA1P42261 906 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 LSSP48449 732 aa10.67□□□□□ -0.7
ANKRD42-209ENST00000533342 MAPK10P53779 464 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms