RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515064.5

LDB2-216, Transcript of LIM domain binding 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene LDB2, Length 2,295 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2-216ENST00000515064 LCN8Q6JVE9 175 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 TMEM81Q6P7N7 255 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 COMMD7Q86VX2 200 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 OR8K5Q8NH50 307 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CBWD1Q9BRT8 395 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 FTHL17Q9BXU8 183 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ZNF358Q9NW07 568 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ING3Q9NXR8 418 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.13□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 G3V2L1 256 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 LINC01387J3KSC0 135 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ARPC2O15144 300 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 AKR7A2O43488 359 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 PLA2G6O60733 806 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SLC22A5O76082 557 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ACADMP11310 421 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ZNF30P17039 623 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 GRIA4P48058 902 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 MAPKAPK2P49137 400 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CCT3P49368 545 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 NOMO3P69849 1222 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 RGS1Q08116 209 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 EPS8Q12929 822 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 BTN1A1Q13410 526 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 IRF5Q13568 498 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 RIN1Q13671 783 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 DAG1Q14118 895 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CASC4Q6P4E1 433 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 RETREG3Q86VR2 466 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SCYL1Q96KG9 808 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SAMD11Q96NU1 681 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 C12orf57Q99622 126 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 GHITMQ9H3K2 345 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 FZD1Q9UP38 647 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CACNG2Q9Y698 323 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 TISP43B9A030 160 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 SSX5O60225 188 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 DFNA5O60443 496 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 TNFRSF21O75509 655 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 C1QBP02746 253 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 FTH1P02794 183 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 MT-ND1P03886 318 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ADORA3P0DMS8 318 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 CD36P16671 472 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 HDCP19113 662 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 AGXTP21549 392 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 ALAS2P22557 587 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 TGFBR1P36897 503 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 MAP2K4P45985 399 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 GYG1P46976 350 aa7.12□□□□□ -1.27
LDB2-216ENST00000515064 NR2C2P49116 596 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms