RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SATB2	Q9UPW6	733 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNK6	Q9Y257	313 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	RAX	Q9Y2V3	346 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-231	ENST00000496246	LRP4	O75096	1905 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC6	O75061	913 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF1	O95521	474 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AGT	P01019	485 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	F3	P13726	295 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CCKBR	P32239	447 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRNA4	P43681	627 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	UCN	P55089	124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	IHH	Q14623	411 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	JAML	Q86YT9	394 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF398	Q8TD17	642 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB8	Q9H765	288 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MYLK	Q15746	1914 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PLD2	O14939	933 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFSF15	O95150	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	FASLG	P48023	281 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CLCNKA	P51800	687 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	EPHA4	P54764	986 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SEPT6	Q14141	434 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL35	Q6PF15	583 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RANBP10	Q6VN20	620 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	NAGS	Q8N159	534 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PAK5	Q9P286	719 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AURKA	O14965	403 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP104	O60308	925 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AP2A1	O95782	977 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	ITGA2B	P08514	1039 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	AMD1	P17707	334 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	MAPK9	P45984	424 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1D5	P58170	312 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH17	Q12864	832 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62

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