RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 NXPE1Q8N323 547 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.06□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 SCRN2Q96FV2 425 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 POM121Q96HA1 1249 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 PSKH2Q96QS6 385 aa6.06□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 FANCEQ9HB96 536 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 CHST11Q9NPF2 352 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 FGF21Q9NSA1 209 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 KLC4Q9NSK0 619 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 POT1Q9NUX5 634 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 OGFRQ9NZT2 677 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 TCFL5Q9UL49 500 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.06□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 C9J4A7 227 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 GRID2O43424 1007 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 PGLSO95336 258 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 JCHAINP01591 159 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 IGHEP01854 428 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.05□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 FOLR1P15328 257 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 TNFAIP3P21580 790 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 MMP8P22894 467 aa6.05□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 KCNAB1Q14722 419 aa6.05□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 OR8K5Q8NH50 307 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 CPT1BQ92523 772 aa6.05□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 CHST8Q9H2A9 424 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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CBX1-205ENST00000495350 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 FZD10Q9ULW2 581 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.05□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.04□□□□□ -1.44
CBX1-205ENST00000495350 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
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