RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 NSG1P42857 185 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TDGQ13569 410 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM52BQ4KMG9 183 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 PAQR3Q6TCH7 311 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM151AQ8N4L1 468 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 COQ10AQ96MF6 247 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TSSK1BQ9BXA7 367 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 HOXB2P14652 356 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 DRD3P35462 400 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC15Q0P6D6 951 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 IER5LQ5T953 404 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 KIAA1211LQ6NV74 962 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ZYG11AQ6WRX3 759 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SPNS2Q8IVW8 549 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CLDN19Q8N6F1 224 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 GRAMD1AQ96CP6 724 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 AP2M1Q96CW1 435 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 DTD2Q96FN9 168 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ABCG8Q9H221 673 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 GPRC6AQ5T6X5 926 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MACC1Q6ZN28 852 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CYP2U1Q7Z449 544 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 AADATQ8N5Z0 425 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CXorf40AQ8TE69 158 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 FADS3Q9Y5Q0 445 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ATG2BQ96BY7 2078 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 IQCF5A8MTL0 148 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TARM1B6A8C7 271 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MMP20O60882 483 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ADAM23O75077 832 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SBK3P0C264 359 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 C6P13671 934 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 GM2AP17900 193 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 RPS14P62263 151 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 BST1Q10588 318 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 STX3Q13277 289 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SLC44A4Q53GD3 710 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TECRLQ5HYJ1 363 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 FAM3CQ92520 227 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 GALPQ9UBC7 116 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 PRSS21Q9Y6M0 314 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 RALBP11234 206 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 TFEBP19484 476 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 COPAP53621 1224 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 FBXO43Q4G163 708 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 PIGWQ7Z7B1 504 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 HDDC3Q8N4P3 179 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CD200R1Q8TD46 325 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 COQ6Q9Y2Z9 468 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 PLXNA2O75051 1894 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SERPINE1P05121 402 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CD1DP15813 335 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 GRK2P25098 689 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 AKT1P31749 480 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 AGBL4Q5VU57 503 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 OTOAQ7RTW8 1153 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 NUS1Q96E22 293 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 DCUN1D1Q96GG9 259 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SLC30A3Q99726 388 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 DERL2Q9GZP9 239 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 OXSMQ9NWU1 459 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 DHRS7Q9Y394 339 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 AP1G1O43747 822 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 CLCN7P51798 805 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 IL2P60568 153 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF765Q7L2R6 523 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ISCA2Q86U28 154 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 SEC16BQ96JE7 1060 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 ALG9Q9H6U8 611 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PQF6 199 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 FADS2P1A8MWK0 482 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CFAP99D6REC4 459 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TSPAN6O43657 245 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ZBTB14O43829 449 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 SNX3O60493 162 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM13O60858 407 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM16O95361 564 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 ATP6V0D1P61421 351 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 B4GALNT1Q00973 533 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-210ENST00000489475 CREB5Q02930 508 aa26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms