RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 POC5Q8NA72 575 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 NDNFQ8TB73 568 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 RNF34Q969K3 372 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 NTAN1Q96AB6 310 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 VPS33AQ96AX1 596 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 LRRC58Q96CX6 371 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CLIP3Q96DZ5 547 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ALG2Q9H553 416 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 AKTIPQ9H8T0 292 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 NDFIP2Q9NV92 336 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PDE10AQ9Y233 779 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SEC24AO95486 1093 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 POMCP01189 267 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 GSTM2P28161 218 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SERPINB10P48595 397 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TRPC1P48995 793 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 GSK3BP49841 420 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PURAQ00577 322 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 DGUOKQ16854 277 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 USP43Q70EL4 1123 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 C19orf60Q96EN9 201 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TMEM74Q96NL1 305 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 GPR78Q96P69 363 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 USP22Q9UPT9 525 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SPO11Q9Y5K1 396 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 MYLKQ15746 1914 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ZNF236Q9UL36 1845 aa13.39□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 THP07101 528 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 THRBP10828 461 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ARSFP54793 590 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 IFITM2Q01629 132 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 LIPEQ05469 1076 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 UGP2Q16851 508 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 UBE2UQ5VVX9 321 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 HACD2Q6Y1H2 254 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 AGMOQ6ZNB7 445 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 USP51Q70EK9 711 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CCDC103Q8IW40 242 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SLC9A7Q96T83 725 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SLC30A3Q99726 388 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 GMIPQ9P107 970 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ILVBLA1L0T0 632 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 A8MT66 165 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 NDUFS2O75306 463 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 UGT2B11O75310 529 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CAPN15O75808 1086 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 MFN2O95140 757 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 AGXTP21549 392 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CPT1AP50416 773 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PYCR3Q53H96 274 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PPP2R2DQ66LE6 453 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 LGI2Q8N0V4 545 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SIX5Q8N196 739 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 MIER2Q8N344 545 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 OSCP1Q8WVF1 389 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 DPF3Q92784 378 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TEKT5Q96M29 485 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN18Q96SJ8 248 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ITM2CQ9NQX7 267 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 VWA7Q9Y334 891 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 H0Y858 1186 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TAF4O00268 1085 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D4O60343 1298 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 NOBOXO60393 691 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 HSD17B1P14061 328 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 GPX3P22352 226 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 NPY2RP49146 381 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 PSMD5Q16401 504 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CXCL17Q6UXB2 119 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 FKBP10Q96AY3 582 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 AP5M1Q9H0R1 490 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.38□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 C8orf4Q9NR00 106 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms