RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FBXO5Q9UKT4 447 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LHX6Q9UPM6 363 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LAMA1P25391 3075 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 EML5Q05BV3 1969 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PPC4 97 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KLHL33A6NCF5 533 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FAM47DPA6NHR8 397 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 H3BMM5 538 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 VEGFDO43915 354 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MAGEC1O60732 1142 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NDUFS3O75489 264 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RHOBTB1O94844 696 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GSTM1P09488 218 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ERVK-10P10266 1014 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KELP23276 732 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ACRV1P26436 265 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CD27P26842 260 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SPRP35270 261 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GP5P40197 560 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MSH2P43246 934 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SEMG2Q02383 582 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GSTM4Q03013 218 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC3Q13217 504 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PTPRCAPQ14761 206 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 WSCD2Q2TBF2 565 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PACS1Q6VY07 963 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IQCHQ86VS3 1027 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RBFAQ8N0V3 343 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IQCKQ8N0W5 287 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NXPE1Q8N323 547 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SCAMP4Q969E2 229 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 GLYATL1Q969I3 302 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SKA1Q96BD8 255 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 BIRC7Q96CA5 298 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 COPS8Q99627 209 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TEX101Q9BY14 249 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ACBD3Q9H3P7 528 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 A0A0U1RQS6 177 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CCDC78A2IDD5 438 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CDH16O75309 829 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KRT38O76015 456 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 AP2A2O94973 939 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FSBPO95073 299 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 C1QAP02745 245 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 IGHV4-34P06331 123 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 INHBAP08476 426 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CD9P21926 228 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 NSG1P42857 185 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RABIFP47224 123 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PPP2CBP62714 309 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 PPP2CAP67775 309 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 FGL2Q14314 439 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CASP8Q14790 479 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 ZNF470Q6ECI4 717 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RAET1GQ6H3X3 334 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CAPN12Q6ZSI9 719 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TAS2R42Q7RTR8 314 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CCDC91Q7Z6B0 441 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 CTAGE3PQ8IX95 158 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RLN3Q8WXF3 142 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 MTBPQ96DY7 904 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 HIC2Q96JB3 615 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 RUFY1Q96T51 708 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-211ENST00000488243 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms