RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480104.5

USP11-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 3

Gene USP11, Length 697 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-208ENST00000480104 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa11.66□□□□□ -0.54
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USP11-208ENST00000480104 SEC14L3Q9UDX4 400 aa11.66□□□□□ -0.54
USP11-208ENST00000480104 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.66□□□□□ -0.54
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USP11-208ENST00000480104 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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USP11-208ENST00000480104 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.65□□□□□ -0.54
USP11-208ENST00000480104 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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USP11-208ENST00000480104 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
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USP11-208ENST00000480104 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.64□□□□□ -0.55
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USP11-208ENST00000480104 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
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USP11-208ENST00000480104 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.64□□□□□ -0.55
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USP11-208ENST00000480104 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.63□□□□□ -0.55
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USP11-208ENST00000480104 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 DNAJC6O75061 913 aa11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 ZWINTO95229 277 aa11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 TNFAIP3P21580 790 aa11.63□□□□□ -0.55
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USP11-208ENST00000480104 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.63□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.62□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 ASMTLO95671 621 aa11.62□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 ERBB2P04626 1255 aa11.62□□□□□ -0.55
USP11-208ENST00000480104 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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