RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 USP37Q86T82 979 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 MITD1Q8WV92 249 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CCDC17Q96LX7 622 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 WDR18Q9BV38 432 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CACNG6Q9BXT2 260 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 U3KQV3 271 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 E7ENQ6 273 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ECI2O75521 394 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ITGA5P08648 1049 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PTNP21246 168 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SP100P23497 879 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC8A1P32418 973 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 FNTBP49356 437 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ENTPD1P49961 510 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 GPLD1P80108 840 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 STX5Q13190 355 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 GAB4Q2WGN9 574 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 STEAP3Q658P3 488 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 C17orf99Q6UX52 265 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF605Q86T29 641 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PDZD3Q86UT5 571 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 TREML1Q86YW5 311 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 RNF169Q8NCN4 708 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 NELFBQ8WX92 580 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CORO2AQ92828 525 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 APOLD1Q96LR9 279 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 OLFM3Q96PB7 478 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 RNF32Q9H0A6 362 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SP140LQ9H930 580 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 TINAGQ9UJW2 476 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.05□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 H3BUI4 141 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 PRRG1O14668 218 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 BET1O15155 118 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 NDUFS2O75306 463 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 UFL1O94874 794 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 TK1P04183 234 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 BRAFP15056 766 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 AGXTP21549 392 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 SAT1P21673 171 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 MAGEA11P43364 429 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 KIR3DL2P43630 455 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 FHITP49789 147 aa6.04□□□□□ -1.44
SMARCE1-208ENST00000474246 RTP1P59025 263 aa6.04□□□□□ -1.44
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