RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 Q6ZS52 159 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 TREML1Q86YW5 311 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CILP2Q8IUL8 1156 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 SCUBE1Q8IWY4 988 aa18.48■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 AADATQ8N5Z0 425 aa18.48■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 RILPQ96NA2 401 aa18.48■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 RIMKLBQ9ULI2 386 aa18.48■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 SAT1P21673 171 aa18.47■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 UGT1A3P35503 534 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 UGT1A5P35504 534 aa18.47■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 SLC1A6P48664 564 aa18.47■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 PDE1BQ01064 536 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 KLC1Q07866 573 aa18.46■□□□□ 0.55
CAPN3-209ENST00000466222 CST6Q15828 149 aa18.46■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 TMEM92Q6UXU6 159 aa18.46■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 CMC1Q7Z7K0 106 aa18.46■□□□□ 0.55
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CAPN3-209ENST00000466222 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 DSG4Q86SJ6 1040 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 SCAMP4Q969E2 229 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 VPS39Q96JC1 886 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.45■□□□□ 0.54
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