RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SUN1	O94901	812 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CDK4	P11802	303 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	AKT1	P31749	480 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	E2F1	Q01094	437 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	BIRC2	Q13490	618 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PEX6	Q13608	980 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CYP1B1	Q16678	543 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	NRROS	Q86YC3	692 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KLK13	Q9UKR3	277 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KCNK6	Q9Y257	313 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		17.55	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DKK1	O94907	266 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CLDN6	P56747	220 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	LRP8	Q14114	963 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	INSC	Q1MX18	579 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MAPK15	Q8TD08	544 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	STYX	Q8WUJ0	223 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	NAT6	Q93015	286 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CASS4	Q9NQ75	786 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		17.54	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	HEATR9	A2RTY3	570 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	FAM149A	A5PLN7	773 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SNX2	O60749	519 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KRT37	O76014	449 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GPR89B	P0CG08	455 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	JUP	P14923	745 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MSH3	P20585	1137 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ITGAL	P20701	1170 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CASQ1	P31415	396 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MC4R	P32245	332 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PAFAH1B1	P43034	410 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	FNTA	P49354	379 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	NFATC2	Q13469	925 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	LAMB3	Q13751	1172 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R7	Q15435	360 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KCND1	Q9NSA2	647 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KLC4	Q9NSK0	619 aa		17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	17.53	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KMO	O15229	486 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	NOBOX	O60393	691 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ECEL1	O95672	775 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GP1BA	P07359	652 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ADRA1D	P25100	572 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CA5A	P35218	305 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	XIAP	P98170	497 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PERM1	Q5SV97	790 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	HES3	Q5TGS1	186 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DET1	Q7L5Y6	550 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	SNX20	Q7Z614	316 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CREG2	Q8IUH2	290 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	GPR156	Q8NFN8	814 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	ULK4	Q96C45	1275 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		17.52	■□□□□ 0.4
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		17.52	■□□□□ 0.4

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