RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 TSPAN19P0C672 248 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NOS3P29474 1203 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MTHFRP42898 656 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RPIAP49247 311 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 HERC3Q15034 1050 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RGS21Q2M5E4 152 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 DPP10Q8N608 796 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NMUR1Q9HB89 426 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ELOVL7A1L3X0 281 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FAM25AB3EWG3 89 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FAM25CB3EWG5 89 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FAM25GB3EWG6 89 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NRP1O14786 923 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 DNAJA2O60884 412 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CXCL14O95715 111 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 IMPDH1P20839 514 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PRKCQQ04759 706 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GALNT2Q10471 571 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GTF2H2Q13888 395 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 AHSGP02765 367 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CPTPQ5TA50 214 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EBF2Q9HAK2 575 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ASF1AQ9Y294 204 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 H3BNX3 289 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 AOC1P19801 751 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PLD4Q96BZ4 506 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 GPR22Q99680 433 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 CLN6Q9NWW5 311 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ARL5AQ9Y689 179 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SQORQ9Y6N5 450 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TBX18O95935 607 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 F2P00734 622 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TRBC1P01850 177 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MT-ND1P03886 318 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SLC6A2P23975 617 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM199Q8N511 208 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ESAMQ96AP7 390 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SUSD3Q96L08 255 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 FNIP2Q9P278 1114 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 OR51F1A6NGY5 319 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SEC24AO95486 1093 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 LAG3P18627 525 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PPCDCQ96CD2 204 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 SMOQ99835 787 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-205ENST00000460170 A0A1W2PQ67 120 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CCDC189A1A4V9 331 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 E7ESA3 106 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 DLX3O60479 287 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 F7P08709 466 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ITGAXP20702 1163 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 CTNNB1P35222 781 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 HNF4AP41235 474 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SMIM11AP58511 58 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 HERVK_113P63132 956 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 USP29Q9HBJ7 922 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 MIOSQ9NXC5 875 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 A0A088AWK7 358 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ITGA1P56199 1179 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SPIBQ01892 262 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 TRIQKQ629K1 86 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-205ENST00000460170 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms