RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BIRC7Q96CA5 298 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NXNL1Q96CM4 212 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RTP4Q96DX8 246 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HSFY1Q96LI6 401 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPHS2Q99611 448 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BTBD2Q9BX70 525 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GMIPQ9P107 970 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE10AQ9Y233 779 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JMP0 313 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0X1KG70 313 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MX80 341 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YC42 278 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AP3D1O14617 1153 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 UBDO15205 165 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NCAM2O15394 837 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MSCO60682 206 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NDST3O95803 873 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CD19P15391 556 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NCK1P16333 377 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ALOX12P18054 663 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TPSB2P20231 275 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 M6PRP20645 277 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FSHRP23945 695 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2B6P58173 313 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TPSAB1Q15661 275 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GDPD3Q7L5L3 318 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PELI3Q8N2H9 469 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL4Q8N3J2 472 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MCFD2Q8NI22 146 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP2Q99490 1192 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RBBP8Q99708 897 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf10Q9HB07 376 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SYBUQ9NX95 663 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.35□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C9JVG2 144 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YAE9 185 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 APOL1O14791 398 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HAT1O14929 419 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPC2O15144 300 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM16O95361 564 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PTTG1O95997 202 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LDLRP01130 860 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CTRB1P17538 263 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPP19P56211 112 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SQLEQ14534 574 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 UGCGQ16739 394 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PYCR3Q53H96 274 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BRMS1LQ5PSV4 323 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM205BPQ63HN1 556 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZYG11AQ6WRX3 759 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CYS1Q717R9 158 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 STRADAQ7RTN6 431 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SVOPQ8N4V2 548 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ARNTL2Q8WYA1 636 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3R3Q92569 461 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX13Q92968 403 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CERS2Q96G23 380 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE1Q99829 537 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 IL22Q9GZX6 179 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 EXD2Q9NVH0 621 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DPP3Q9NY33 737 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 EDARQ9UNE0 448 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPC5OSA6NMA1 111 aa8.34□□□□□ -1.07
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